Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 C7orf50-207ENST00000488073 853 ntTSL 518■□□□□ 0.477e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.453e-13■■■■□ 24
ILF3Q12906 CNOT2-227ENST00000551043 2288 ntTSL 217.69■□□□□ 0.427e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 PDHB-208ENST00000480626 710 ntTSL 317.57■□□□□ 0.47e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 CNOT2-236ENST00000552231 1545 ntTSL 217.29■□□□□ 0.367e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 SFSWAP-207ENST00000538548 2636 ntTSL 517.14■□□□□ 0.332e-6■■■■□ 24
ILF3Q12906 TMEM94-225ENST00000582455 564 ntTSL 417.13■□□□□ 0.337e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 TMEM94-233ENST00000585277 581 ntTSL 316.31■□□□□ 0.27e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.165e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.037e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 C7orf50-205ENST00000444428 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.22■□□□□ 0.037e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 GSE1-205ENST00000412692 6625 ntTSL 515.06■□□□□ 07e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 CNOT2-209ENST00000548159 2549 ntTSL 1 (best)14.8□□□□□ -0.047e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 HACD2-202ENST00000469317 590 ntTSL 314.79□□□□□ -0.047e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.077e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.087e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.177e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 PDHB-202ENST00000383714 1478 ntTSL 1 (best)13.67□□□□□ -0.227e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 CNOT2-220ENST00000549750 1085 ntTSL 513.64□□□□□ -0.237e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 NT5C3A-208ENST00000456458 1742 ntTSL 1 (best)13.6□□□□□ -0.235e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 PDHB-207ENST00000479945 4459 ntTSL 213.55□□□□□ -0.247e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 PDHB-204ENST00000469364 1616 ntTSL 513.55□□□□□ -0.247e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.245e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.263e-13■■■■□ 24
ILF3Q12906 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.282e-6■■■■□ 24
ILF3Q12906 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.297e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.37e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.32e-6■■■■□ 24
ILF3Q12906 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.37e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 TMEM94-213ENST00000580416 430 ntTSL 413.09□□□□□ -0.317e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 HDAC1-203ENST00000463172 895 ntTSL 213.08□□□□□ -0.327e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 HDAC1-207ENST00000481281 721 ntTSL 512.95□□□□□ -0.347e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 CHIC2-203ENST00000510894 528 ntTSL 212.94□□□□□ -0.343e-13■■■■□ 24
ILF3Q12906 TMEM94-217ENST00000581085 5432 ntTSL 212.58□□□□□ -0.47e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.451e-6■■■■□ 24
ILF3Q12906 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.471e-6■■■■□ 24
ILF3Q12906 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.477e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 GIGYF2-215ENST00000427649 677 ntTSL 511.99□□□□□ -0.497e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 GIGYF2-221ENST00000445650 588 ntTSL 311.9□□□□□ -0.57e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 CNOT2-241ENST00000552915 1071 ntTSL 511.86□□□□□ -0.517e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 NT5C3A-214ENST00000620705 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.545e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 TMEM94-218ENST00000581252 522 ntTSL 511.59□□□□□ -0.557e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 HSPB11-204ENST00000371378 894 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.577e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 CNOT2-223ENST00000550160 993 ntTSL 511.4□□□□□ -0.587e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 GIGYF2-219ENST00000436349 547 ntTSL 411.35□□□□□ -0.597e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 SORL1-201ENST00000260197 10904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.597e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 HNRNPR-203ENST00000374616 2691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.597e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 PRPF40A-202ENST00000410080 8048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.631e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 HNRNPR-202ENST00000374612 2694 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.647e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 KNOP1-201ENST00000219837 6432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.653e-13■■■■□ 24
ILF3Q12906 CNOT2-239ENST00000552483 895 ntTSL 510.72□□□□□ -0.697e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 GIGYF2-208ENST00000421778 564 ntTSL 410.6□□□□□ -0.717e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 HNRNPR-201ENST00000302271 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.727e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 CNOT2-202ENST00000418359 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.737e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 TMEM94-209ENST00000579208 3543 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.747e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 CNOT2-201ENST00000229195 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.777e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 GIGYF2-211ENST00000424414 583 ntTSL 49.99□□□□□ -0.817e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 AC093152.1-201ENST00000495684 564 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.817e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 CNOT2-228ENST00000551132 618 ntTSL 39.75□□□□□ -0.857e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 CNOT2-205ENST00000547321 577 ntTSL 29.75□□□□□ -0.857e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 TEX10-201ENST00000374902 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.867e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 TEX10-204ENST00000535814 3006 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.957e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 GIGYF2-222ENST00000455139 556 ntTSL 59.01□□□□□ -0.977e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 ZCCHC11-211ENST00000474453 1010 ntTSL 58.88□□□□□ -0.997e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 XRCC6-208ENST00000478914 550 ntTSL 28.73□□□□□ -1.017e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 SORL1-204ENST00000525532 3836 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.057e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 SFSWAP-202ENST00000535202 567 ntTSL 28.51□□□□□ -1.052e-6■■■■□ 24
ILF3Q12906 HDAC1-202ENST00000428704 664 ntTSL 28.39□□□□□ -1.077e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.17e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.117e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 CNOT2-208ENST00000548021 724 ntTSL 28.05□□□□□ -1.127e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 CNOT2-225ENST00000550641 964 ntTSL 58.05□□□□□ -1.127e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 CHD6-201ENST00000309279 1635 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.137e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 CHD6-205ENST00000440697 1635 ntTSL 58□□□□□ -1.137e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.253e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 CNOT2-237ENST00000552319 783 ntTSL 57.15□□□□□ -1.267e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 CNOT2-217ENST00000549443 457 ntTSL 47.15□□□□□ -1.267e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.33e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 NT5C3A-201ENST00000242210 1670 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.315e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 HNRNPR-207ENST00000470941 560 ntTSL 46.65□□□□□ -1.347e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 HNRNPR-205ENST00000463552 837 ntTSL 46.41□□□□□ -1.387e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 CNOT2-224ENST00000550194 747 ntTSL 56.27□□□□□ -1.417e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 CNOT2-212ENST00000548599 643 ntTSL 56.27□□□□□ -1.417e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 CNOT2-234ENST00000551873 677 ntTSL 56.27□□□□□ -1.417e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 HDAC1-205ENST00000472928 532 ntTSL 26.1□□□□□ -1.437e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 HNRNPR-208ENST00000476451 814 ntTSL 46□□□□□ -1.457e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 ZCCHC11-206ENST00000469810 3757 ntTSL 25.97□□□□□ -1.457e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.527e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.541e-6■■■■□ 24
ILF3Q12906 ZRANB3-203ENST00000403017 4130 ntTSL 55.14□□□□□ -1.593e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 RALGAPB-206ENST00000461423 3830 ntTSL 24.86□□□□□ -1.631e-6■■■■□ 24
ILF3Q12906 CNOT2-215ENST00000548863 737 ntTSL 34.73□□□□□ -1.657e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 CHM-202ENST00000467744 2040 ntTSL 54.7□□□□□ -1.667e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 ZCCHC11-221ENST00000531722 1016 ntTSL 34.65□□□□□ -1.677e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.683e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 RALGAPB-204ENST00000438490 4075 ntTSL 54.23□□□□□ -1.731e-6■■■■□ 24
ILF3Q12906 PRH1-203ENST00000538332 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 54.03□□□□□ -1.767e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 HSPB11-206ENST00000489675 879 ntTSL 23.62□□□□□ -1.837e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.917e-7■■■■□ 24
ILF3Q12906 CNOT2-235ENST00000552151 1682 ntTSL 22.82□□□□□ -1.967e-7■■■■□ 24
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