Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKP3Q9Y446 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKP3Q9Y446 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKP3Q9Y446 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKP3Q9Y446 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PKP3Q9Y446 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PKP3Q9Y446 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKP3Q9Y446 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKP3Q9Y446 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKP3Q9Y446 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKP3Q9Y446 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKP3Q9Y446 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKP3Q9Y446 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKP3Q9Y446 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKP3Q9Y446 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKP3Q9Y446 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKP3Q9Y446 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKP3Q9Y446 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKP3Q9Y446 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKP3Q9Y446 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKP3Q9Y446 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKP3Q9Y446 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKP3Q9Y446 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKP3Q9Y446 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKP3Q9Y446 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKP3Q9Y446 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKP3Q9Y446 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKP3Q9Y446 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKP3Q9Y446 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKP3Q9Y446 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKP3Q9Y446 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKP3Q9Y446 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKP3Q9Y446 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKP3Q9Y446 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKP3Q9Y446 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKP3Q9Y446 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKP3Q9Y446 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PKP3Q9Y446 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PKP3Q9Y446 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PKP3Q9Y446 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PKP3Q9Y446 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKP3Q9Y446 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PKP3Q9Y446 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKP3Q9Y446 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKP3Q9Y446 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKP3Q9Y446 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKP3Q9Y446 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKP3Q9Y446 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKP3Q9Y446 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKP3Q9Y446 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKP3Q9Y446 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKP3Q9Y446 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKP3Q9Y446 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKP3Q9Y446 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKP3Q9Y446 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKP3Q9Y446 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKP3Q9Y446 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PKP3Q9Y446 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKP3Q9Y446 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKP3Q9Y446 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKP3Q9Y446 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKP3Q9Y446 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKP3Q9Y446 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKP3Q9Y446 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKP3Q9Y446 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKP3Q9Y446 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKP3Q9Y446 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKP3Q9Y446 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKP3Q9Y446 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKP3Q9Y446 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKP3Q9Y446 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKP3Q9Y446 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKP3Q9Y446 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKP3Q9Y446 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKP3Q9Y446 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PKP3Q9Y446 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKP3Q9Y446 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKP3Q9Y446 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKP3Q9Y446 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKP3Q9Y446 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKP3Q9Y446 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKP3Q9Y446 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PKP3Q9Y446 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKP3Q9Y446 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKP3Q9Y446 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKP3Q9Y446 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKP3Q9Y446 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKP3Q9Y446 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKP3Q9Y446 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKP3Q9Y446 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKP3Q9Y446 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKP3Q9Y446 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PKP3Q9Y446 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKP3Q9Y446 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKP3Q9Y446 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKP3Q9Y446 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKP3Q9Y446 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKP3Q9Y446 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKP3Q9Y446 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKP3Q9Y446 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms