Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLIP2Q9UDT6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP2Q9UDT6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP2Q9UDT6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
CLIP2Q9UDT6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CLIP2Q9UDT6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CLIP2Q9UDT6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLIP2Q9UDT6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLIP2Q9UDT6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLIP2Q9UDT6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLIP2Q9UDT6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLIP2Q9UDT6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CLIP2Q9UDT6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLIP2Q9UDT6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLIP2Q9UDT6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLIP2Q9UDT6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLIP2Q9UDT6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLIP2Q9UDT6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CLIP2Q9UDT6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CLIP2Q9UDT6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLIP2Q9UDT6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLIP2Q9UDT6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLIP2Q9UDT6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLIP2Q9UDT6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CLIP2Q9UDT6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CLIP2Q9UDT6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CLIP2Q9UDT6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLIP2Q9UDT6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLIP2Q9UDT6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLIP2Q9UDT6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLIP2Q9UDT6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLIP2Q9UDT6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLIP2Q9UDT6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CLIP2Q9UDT6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CLIP2Q9UDT6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLIP2Q9UDT6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLIP2Q9UDT6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLIP2Q9UDT6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLIP2Q9UDT6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLIP2Q9UDT6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CLIP2Q9UDT6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
CLIP2Q9UDT6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CLIP2Q9UDT6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CLIP2Q9UDT6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CLIP2Q9UDT6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CLIP2Q9UDT6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CLIP2Q9UDT6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLIP2Q9UDT6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CLIP2Q9UDT6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CLIP2Q9UDT6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CLIP2Q9UDT6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CLIP2Q9UDT6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CLIP2Q9UDT6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLIP2Q9UDT6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLIP2Q9UDT6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLIP2Q9UDT6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLIP2Q9UDT6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLIP2Q9UDT6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLIP2Q9UDT6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLIP2Q9UDT6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CLIP2Q9UDT6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLIP2Q9UDT6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLIP2Q9UDT6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLIP2Q9UDT6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLIP2Q9UDT6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLIP2Q9UDT6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLIP2Q9UDT6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLIP2Q9UDT6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLIP2Q9UDT6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLIP2Q9UDT6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLIP2Q9UDT6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLIP2Q9UDT6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLIP2Q9UDT6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CLIP2Q9UDT6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CLIP2Q9UDT6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CLIP2Q9UDT6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CLIP2Q9UDT6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CLIP2Q9UDT6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CLIP2Q9UDT6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CLIP2Q9UDT6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CLIP2Q9UDT6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CLIP2Q9UDT6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CLIP2Q9UDT6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CLIP2Q9UDT6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CLIP2Q9UDT6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CLIP2Q9UDT6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CLIP2Q9UDT6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CLIP2Q9UDT6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CLIP2Q9UDT6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CLIP2Q9UDT6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CLIP2Q9UDT6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CLIP2Q9UDT6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CLIP2Q9UDT6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CLIP2Q9UDT6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLIP2Q9UDT6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLIP2Q9UDT6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLIP2Q9UDT6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLIP2Q9UDT6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLIP2Q9UDT6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CLIP2Q9UDT6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms