Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS4

DNAJB11, DnaJ homolog subfamily B member 11, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB11Q9UBS4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJB11Q9UBS4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAJB11Q9UBS4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJB11Q9UBS4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJB11Q9UBS4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJB11Q9UBS4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJB11Q9UBS4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAJB11Q9UBS4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAJB11Q9UBS4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAJB11Q9UBS4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJB11Q9UBS4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJB11Q9UBS4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJB11Q9UBS4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJB11Q9UBS4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJB11Q9UBS4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJB11Q9UBS4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAJB11Q9UBS4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAJB11Q9UBS4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAJB11Q9UBS4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJB11Q9UBS4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJB11Q9UBS4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJB11Q9UBS4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJB11Q9UBS4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJB11Q9UBS4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJB11Q9UBS4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJB11Q9UBS4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJB11Q9UBS4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNAJB11Q9UBS4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJB11Q9UBS4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJB11Q9UBS4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJB11Q9UBS4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJB11Q9UBS4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJB11Q9UBS4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJB11Q9UBS4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJB11Q9UBS4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJB11Q9UBS4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJB11Q9UBS4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAJB11Q9UBS4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJB11Q9UBS4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJB11Q9UBS4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJB11Q9UBS4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAJB11Q9UBS4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJB11Q9UBS4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJB11Q9UBS4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJB11Q9UBS4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJB11Q9UBS4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAJB11Q9UBS4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB11Q9UBS4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAJB11Q9UBS4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJB11Q9UBS4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJB11Q9UBS4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAJB11Q9UBS4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAJB11Q9UBS4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJB11Q9UBS4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAJB11Q9UBS4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJB11Q9UBS4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJB11Q9UBS4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAJB11Q9UBS4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJB11Q9UBS4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAJB11Q9UBS4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNAJB11Q9UBS4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNAJB11Q9UBS4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAJB11Q9UBS4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAJB11Q9UBS4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJB11Q9UBS4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAJB11Q9UBS4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJB11Q9UBS4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAJB11Q9UBS4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJB11Q9UBS4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJB11Q9UBS4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJB11Q9UBS4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJB11Q9UBS4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAJB11Q9UBS4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAJB11Q9UBS4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJB11Q9UBS4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAJB11Q9UBS4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAJB11Q9UBS4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJB11Q9UBS4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJB11Q9UBS4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJB11Q9UBS4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJB11Q9UBS4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJB11Q9UBS4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJB11Q9UBS4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJB11Q9UBS4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJB11Q9UBS4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJB11Q9UBS4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJB11Q9UBS4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJB11Q9UBS4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJB11Q9UBS4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJB11Q9UBS4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJB11Q9UBS4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJB11Q9UBS4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJB11Q9UBS4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJB11Q9UBS4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJB11Q9UBS4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJB11Q9UBS4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJB11Q9UBS4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJB11Q9UBS4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJB11Q9UBS4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJB11Q9UBS4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms