Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GALPQ9UBC7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GALPQ9UBC7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GALPQ9UBC7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GALPQ9UBC7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GALPQ9UBC7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GALPQ9UBC7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GALPQ9UBC7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GALPQ9UBC7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GALPQ9UBC7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GALPQ9UBC7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GALPQ9UBC7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GALPQ9UBC7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GALPQ9UBC7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GALPQ9UBC7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GALPQ9UBC7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GALPQ9UBC7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GALPQ9UBC7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GALPQ9UBC7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GALPQ9UBC7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GALPQ9UBC7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GALPQ9UBC7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GALPQ9UBC7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GALPQ9UBC7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GALPQ9UBC7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GALPQ9UBC7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GALPQ9UBC7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GALPQ9UBC7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GALPQ9UBC7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GALPQ9UBC7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GALPQ9UBC7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GALPQ9UBC7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GALPQ9UBC7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GALPQ9UBC7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GALPQ9UBC7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GALPQ9UBC7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GALPQ9UBC7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GALPQ9UBC7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GALPQ9UBC7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GALPQ9UBC7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GALPQ9UBC7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GALPQ9UBC7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GALPQ9UBC7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GALPQ9UBC7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GALPQ9UBC7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GALPQ9UBC7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GALPQ9UBC7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GALPQ9UBC7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GALPQ9UBC7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GALPQ9UBC7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GALPQ9UBC7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GALPQ9UBC7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GALPQ9UBC7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GALPQ9UBC7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GALPQ9UBC7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GALPQ9UBC7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GALPQ9UBC7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GALPQ9UBC7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GALPQ9UBC7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GALPQ9UBC7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GALPQ9UBC7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GALPQ9UBC7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GALPQ9UBC7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GALPQ9UBC7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GALPQ9UBC7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GALPQ9UBC7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GALPQ9UBC7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GALPQ9UBC7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GALPQ9UBC7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GALPQ9UBC7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GALPQ9UBC7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GALPQ9UBC7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GALPQ9UBC7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GALPQ9UBC7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GALPQ9UBC7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GALPQ9UBC7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GALPQ9UBC7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GALPQ9UBC7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GALPQ9UBC7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GALPQ9UBC7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GALPQ9UBC7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GALPQ9UBC7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GALPQ9UBC7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GALPQ9UBC7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GALPQ9UBC7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GALPQ9UBC7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GALPQ9UBC7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GALPQ9UBC7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GALPQ9UBC7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GALPQ9UBC7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GALPQ9UBC7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GALPQ9UBC7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GALPQ9UBC7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GALPQ9UBC7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GALPQ9UBC7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GALPQ9UBC7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GALPQ9UBC7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GALPQ9UBC7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GALPQ9UBC7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GALPQ9UBC7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms