Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
LRP2BPQ9P2M1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LRP2BPQ9P2M1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LRP2BPQ9P2M1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LRP2BPQ9P2M1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LRP2BPQ9P2M1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LRP2BPQ9P2M1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LRP2BPQ9P2M1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LRP2BPQ9P2M1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LRP2BPQ9P2M1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LRP2BPQ9P2M1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRP2BPQ9P2M1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LRP2BPQ9P2M1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
LRP2BPQ9P2M1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
LRP2BPQ9P2M1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
LRP2BPQ9P2M1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRP2BPQ9P2M1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRP2BPQ9P2M1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRP2BPQ9P2M1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LRP2BPQ9P2M1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
LRP2BPQ9P2M1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRP2BPQ9P2M1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LRP2BPQ9P2M1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
LRP2BPQ9P2M1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRP2BPQ9P2M1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LRP2BPQ9P2M1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRP2BPQ9P2M1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LRP2BPQ9P2M1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
LRP2BPQ9P2M1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRP2BPQ9P2M1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LRP2BPQ9P2M1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LRP2BPQ9P2M1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRP2BPQ9P2M1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRP2BPQ9P2M1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
LRP2BPQ9P2M1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
LRP2BPQ9P2M1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
LRP2BPQ9P2M1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LRP2BPQ9P2M1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LRP2BPQ9P2M1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRP2BPQ9P2M1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRP2BPQ9P2M1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LRP2BPQ9P2M1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRP2BPQ9P2M1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRP2BPQ9P2M1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRP2BPQ9P2M1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
LRP2BPQ9P2M1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRP2BPQ9P2M1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LRP2BPQ9P2M1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LRP2BPQ9P2M1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LRP2BPQ9P2M1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRP2BPQ9P2M1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LRP2BPQ9P2M1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LRP2BPQ9P2M1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRP2BPQ9P2M1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRP2BPQ9P2M1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRP2BPQ9P2M1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRP2BPQ9P2M1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRP2BPQ9P2M1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRP2BPQ9P2M1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRP2BPQ9P2M1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LRP2BPQ9P2M1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LRP2BPQ9P2M1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRP2BPQ9P2M1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRP2BPQ9P2M1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRP2BPQ9P2M1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRP2BPQ9P2M1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRP2BPQ9P2M1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRP2BPQ9P2M1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LRP2BPQ9P2M1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRP2BPQ9P2M1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRP2BPQ9P2M1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRP2BPQ9P2M1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRP2BPQ9P2M1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LRP2BPQ9P2M1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
LRP2BPQ9P2M1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LRP2BPQ9P2M1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LRP2BPQ9P2M1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRP2BPQ9P2M1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRP2BPQ9P2M1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRP2BPQ9P2M1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRP2BPQ9P2M1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRP2BPQ9P2M1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LRP2BPQ9P2M1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LRP2BPQ9P2M1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
LRP2BPQ9P2M1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRP2BPQ9P2M1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRP2BPQ9P2M1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRP2BPQ9P2M1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
LRP2BPQ9P2M1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
LRP2BPQ9P2M1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LRP2BPQ9P2M1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRP2BPQ9P2M1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRP2BPQ9P2M1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRP2BPQ9P2M1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRP2BPQ9P2M1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
LRP2BPQ9P2M1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
LRP2BPQ9P2M1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LRP2BPQ9P2M1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LRP2BPQ9P2M1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LRP2BPQ9P2M1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms