Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HACD3Q9P035 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HACD3Q9P035 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HACD3Q9P035 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HACD3Q9P035 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HACD3Q9P035 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HACD3Q9P035 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HACD3Q9P035 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HACD3Q9P035 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HACD3Q9P035 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HACD3Q9P035 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HACD3Q9P035 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HACD3Q9P035 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HACD3Q9P035 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HACD3Q9P035 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HACD3Q9P035 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HACD3Q9P035 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HACD3Q9P035 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HACD3Q9P035 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HACD3Q9P035 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HACD3Q9P035 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HACD3Q9P035 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HACD3Q9P035 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HACD3Q9P035 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HACD3Q9P035 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HACD3Q9P035 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HACD3Q9P035 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HACD3Q9P035 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
HACD3Q9P035 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HACD3Q9P035 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HACD3Q9P035 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HACD3Q9P035 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HACD3Q9P035 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HACD3Q9P035 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HACD3Q9P035 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HACD3Q9P035 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HACD3Q9P035 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HACD3Q9P035 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HACD3Q9P035 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HACD3Q9P035 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HACD3Q9P035 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HACD3Q9P035 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HACD3Q9P035 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HACD3Q9P035 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HACD3Q9P035 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HACD3Q9P035 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HACD3Q9P035 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HACD3Q9P035 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HACD3Q9P035 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HACD3Q9P035 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HACD3Q9P035 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HACD3Q9P035 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HACD3Q9P035 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HACD3Q9P035 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HACD3Q9P035 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HACD3Q9P035 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HACD3Q9P035 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HACD3Q9P035 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HACD3Q9P035 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HACD3Q9P035 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HACD3Q9P035 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HACD3Q9P035 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HACD3Q9P035 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HACD3Q9P035 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HACD3Q9P035 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HACD3Q9P035 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HACD3Q9P035 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HACD3Q9P035 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HACD3Q9P035 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HACD3Q9P035 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HACD3Q9P035 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HACD3Q9P035 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HACD3Q9P035 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HACD3Q9P035 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HACD3Q9P035 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HACD3Q9P035 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HACD3Q9P035 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HACD3Q9P035 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HACD3Q9P035 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HACD3Q9P035 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HACD3Q9P035 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HACD3Q9P035 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HACD3Q9P035 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HACD3Q9P035 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HACD3Q9P035 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HACD3Q9P035 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HACD3Q9P035 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HACD3Q9P035 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HACD3Q9P035 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HACD3Q9P035 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HACD3Q9P035 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HACD3Q9P035 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HACD3Q9P035 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HACD3Q9P035 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HACD3Q9P035 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HACD3Q9P035 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HACD3Q9P035 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HACD3Q9P035 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HACD3Q9P035 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HACD3Q9P035 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms