Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD1Q9GZZ0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD1Q9GZZ0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD1Q9GZZ0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD1Q9GZZ0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD1Q9GZZ0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD1Q9GZZ0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD1Q9GZZ0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD1Q9GZZ0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD1Q9GZZ0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD1Q9GZZ0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD1Q9GZZ0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD1Q9GZZ0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD1Q9GZZ0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD1Q9GZZ0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXD1Q9GZZ0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXD1Q9GZZ0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXD1Q9GZZ0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXD1Q9GZZ0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD1Q9GZZ0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD1Q9GZZ0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD1Q9GZZ0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD1Q9GZZ0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD1Q9GZZ0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD1Q9GZZ0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD1Q9GZZ0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXD1Q9GZZ0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXD1Q9GZZ0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD1Q9GZZ0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD1Q9GZZ0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD1Q9GZZ0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD1Q9GZZ0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD1Q9GZZ0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD1Q9GZZ0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD1Q9GZZ0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD1Q9GZZ0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD1Q9GZZ0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD1Q9GZZ0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD1Q9GZZ0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD1Q9GZZ0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD1Q9GZZ0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD1Q9GZZ0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD1Q9GZZ0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD1Q9GZZ0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD1Q9GZZ0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD1Q9GZZ0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD1Q9GZZ0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD1Q9GZZ0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD1Q9GZZ0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD1Q9GZZ0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD1Q9GZZ0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD1Q9GZZ0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD1Q9GZZ0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD1Q9GZZ0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD1Q9GZZ0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD1Q9GZZ0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD1Q9GZZ0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD1Q9GZZ0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD1Q9GZZ0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD1Q9GZZ0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD1Q9GZZ0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD1Q9GZZ0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD1Q9GZZ0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD1Q9GZZ0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD1Q9GZZ0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD1Q9GZZ0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD1Q9GZZ0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD1Q9GZZ0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD1Q9GZZ0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD1Q9GZZ0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD1Q9GZZ0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD1Q9GZZ0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD1Q9GZZ0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD1Q9GZZ0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD1Q9GZZ0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD1Q9GZZ0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD1Q9GZZ0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD1Q9GZZ0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD1Q9GZZ0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD1Q9GZZ0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD1Q9GZZ0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXD1Q9GZZ0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD1Q9GZZ0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD1Q9GZZ0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD1Q9GZZ0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXD1Q9GZZ0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD1Q9GZZ0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD1Q9GZZ0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXD1Q9GZZ0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD1Q9GZZ0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXD1Q9GZZ0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD1Q9GZZ0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXD1Q9GZZ0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXD1Q9GZZ0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD1Q9GZZ0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXD1Q9GZZ0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD1Q9GZZ0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXD1Q9GZZ0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXD1Q9GZZ0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXD1Q9GZZ0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms