Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCF12Q99081 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCF12Q99081 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCF12Q99081 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCF12Q99081 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCF12Q99081 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCF12Q99081 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCF12Q99081 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCF12Q99081 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCF12Q99081 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCF12Q99081 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCF12Q99081 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TCF12Q99081 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCF12Q99081 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCF12Q99081 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCF12Q99081 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCF12Q99081 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCF12Q99081 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCF12Q99081 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCF12Q99081 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCF12Q99081 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCF12Q99081 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCF12Q99081 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCF12Q99081 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TCF12Q99081 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TCF12Q99081 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TCF12Q99081 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TCF12Q99081 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TCF12Q99081 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TCF12Q99081 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TCF12Q99081 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCF12Q99081 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCF12Q99081 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCF12Q99081 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCF12Q99081 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCF12Q99081 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCF12Q99081 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCF12Q99081 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCF12Q99081 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCF12Q99081 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCF12Q99081 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCF12Q99081 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCF12Q99081 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCF12Q99081 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCF12Q99081 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCF12Q99081 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCF12Q99081 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCF12Q99081 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCF12Q99081 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCF12Q99081 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCF12Q99081 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCF12Q99081 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCF12Q99081 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCF12Q99081 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCF12Q99081 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCF12Q99081 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TCF12Q99081 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCF12Q99081 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCF12Q99081 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCF12Q99081 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCF12Q99081 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCF12Q99081 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCF12Q99081 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCF12Q99081 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCF12Q99081 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCF12Q99081 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCF12Q99081 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCF12Q99081 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCF12Q99081 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCF12Q99081 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCF12Q99081 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCF12Q99081 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCF12Q99081 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCF12Q99081 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCF12Q99081 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCF12Q99081 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TCF12Q99081 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCF12Q99081 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCF12Q99081 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TCF12Q99081 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCF12Q99081 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TCF12Q99081 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TCF12Q99081 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TCF12Q99081 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TCF12Q99081 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TCF12Q99081 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCF12Q99081 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TCF12Q99081 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TCF12Q99081 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCF12Q99081 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCF12Q99081 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TCF12Q99081 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TCF12Q99081 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCF12Q99081 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TCF12Q99081 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCF12Q99081 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCF12Q99081 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCF12Q99081 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCF12Q99081 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCF12Q99081 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms