Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUDCD1Q96RS6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUDCD1Q96RS6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUDCD1Q96RS6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUDCD1Q96RS6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUDCD1Q96RS6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUDCD1Q96RS6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUDCD1Q96RS6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUDCD1Q96RS6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUDCD1Q96RS6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUDCD1Q96RS6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUDCD1Q96RS6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUDCD1Q96RS6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDCD1Q96RS6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDCD1Q96RS6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDCD1Q96RS6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDCD1Q96RS6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDCD1Q96RS6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDCD1Q96RS6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUDCD1Q96RS6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDCD1Q96RS6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDCD1Q96RS6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDCD1Q96RS6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUDCD1Q96RS6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUDCD1Q96RS6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUDCD1Q96RS6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUDCD1Q96RS6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUDCD1Q96RS6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUDCD1Q96RS6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUDCD1Q96RS6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUDCD1Q96RS6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUDCD1Q96RS6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUDCD1Q96RS6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUDCD1Q96RS6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUDCD1Q96RS6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUDCD1Q96RS6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUDCD1Q96RS6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUDCD1Q96RS6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUDCD1Q96RS6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUDCD1Q96RS6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUDCD1Q96RS6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUDCD1Q96RS6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUDCD1Q96RS6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUDCD1Q96RS6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUDCD1Q96RS6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUDCD1Q96RS6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUDCD1Q96RS6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUDCD1Q96RS6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUDCD1Q96RS6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUDCD1Q96RS6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUDCD1Q96RS6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUDCD1Q96RS6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUDCD1Q96RS6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUDCD1Q96RS6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUDCD1Q96RS6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUDCD1Q96RS6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUDCD1Q96RS6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUDCD1Q96RS6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUDCD1Q96RS6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUDCD1Q96RS6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUDCD1Q96RS6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUDCD1Q96RS6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUDCD1Q96RS6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUDCD1Q96RS6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NUDCD1Q96RS6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUDCD1Q96RS6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUDCD1Q96RS6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUDCD1Q96RS6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUDCD1Q96RS6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUDCD1Q96RS6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUDCD1Q96RS6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUDCD1Q96RS6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUDCD1Q96RS6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUDCD1Q96RS6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUDCD1Q96RS6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUDCD1Q96RS6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUDCD1Q96RS6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUDCD1Q96RS6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUDCD1Q96RS6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUDCD1Q96RS6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUDCD1Q96RS6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUDCD1Q96RS6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUDCD1Q96RS6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUDCD1Q96RS6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUDCD1Q96RS6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUDCD1Q96RS6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NUDCD1Q96RS6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUDCD1Q96RS6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUDCD1Q96RS6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUDCD1Q96RS6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUDCD1Q96RS6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUDCD1Q96RS6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUDCD1Q96RS6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUDCD1Q96RS6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUDCD1Q96RS6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUDCD1Q96RS6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUDCD1Q96RS6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NUDCD1Q96RS6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUDCD1Q96RS6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUDCD1Q96RS6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms