Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF2

STAC3, SH3 and cysteine-rich domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAC3Q96MF2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
STAC3Q96MF2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
STAC3Q96MF2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC40.05■■■■■ 4
STAC3Q96MF2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
STAC3Q96MF2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
STAC3Q96MF2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
STAC3Q96MF2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
STAC3Q96MF2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
STAC3Q96MF2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC40.02■■■■■ 4
STAC3Q96MF2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
STAC3Q96MF2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
STAC3Q96MF2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
STAC3Q96MF2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
STAC3Q96MF2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
STAC3Q96MF2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC39.95■■■■□ 3.99
STAC3Q96MF2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
STAC3Q96MF2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
STAC3Q96MF2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
STAC3Q96MF2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
STAC3Q96MF2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
STAC3Q96MF2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
STAC3Q96MF2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
STAC3Q96MF2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
STAC3Q96MF2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
STAC3Q96MF2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
STAC3Q96MF2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
STAC3Q96MF2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC39.82■■■■□ 3.96
STAC3Q96MF2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
STAC3Q96MF2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
STAC3Q96MF2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
STAC3Q96MF2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.74■■■■□ 3.95
STAC3Q96MF2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
STAC3Q96MF2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
STAC3Q96MF2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
STAC3Q96MF2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
STAC3Q96MF2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
STAC3Q96MF2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
STAC3Q96MF2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
STAC3Q96MF2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
STAC3Q96MF2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
STAC3Q96MF2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
STAC3Q96MF2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
STAC3Q96MF2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
STAC3Q96MF2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
STAC3Q96MF2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
STAC3Q96MF2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
STAC3Q96MF2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
STAC3Q96MF2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
STAC3Q96MF2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
STAC3Q96MF2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
STAC3Q96MF2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.47■■■■□ 3.91
STAC3Q96MF2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
STAC3Q96MF2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
STAC3Q96MF2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
STAC3Q96MF2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
STAC3Q96MF2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
STAC3Q96MF2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
STAC3Q96MF2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
STAC3Q96MF2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
STAC3Q96MF2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
STAC3Q96MF2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
STAC3Q96MF2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
STAC3Q96MF2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
STAC3Q96MF2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
STAC3Q96MF2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
STAC3Q96MF2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
STAC3Q96MF2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
STAC3Q96MF2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
STAC3Q96MF2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
STAC3Q96MF2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
STAC3Q96MF2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
STAC3Q96MF2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
STAC3Q96MF2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
STAC3Q96MF2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
STAC3Q96MF2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC39.24■■■■□ 3.87
STAC3Q96MF2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
STAC3Q96MF2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
STAC3Q96MF2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
STAC3Q96MF2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
STAC3Q96MF2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
STAC3Q96MF2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
STAC3Q96MF2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
STAC3Q96MF2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
STAC3Q96MF2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
STAC3Q96MF2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
STAC3Q96MF2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
STAC3Q96MF2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
STAC3Q96MF2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
STAC3Q96MF2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
STAC3Q96MF2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
STAC3Q96MF2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
STAC3Q96MF2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
STAC3Q96MF2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
STAC3Q96MF2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
STAC3Q96MF2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
STAC3Q96MF2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
STAC3Q96MF2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
STAC3Q96MF2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
STAC3Q96MF2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
STAC3Q96MF2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms