Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA7

SDSL, Serine dehydratase-like, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSLQ96GA7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDSLQ96GA7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDSLQ96GA7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDSLQ96GA7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDSLQ96GA7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDSLQ96GA7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDSLQ96GA7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDSLQ96GA7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDSLQ96GA7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDSLQ96GA7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDSLQ96GA7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDSLQ96GA7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDSLQ96GA7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDSLQ96GA7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDSLQ96GA7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDSLQ96GA7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDSLQ96GA7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDSLQ96GA7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSLQ96GA7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSLQ96GA7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSLQ96GA7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSLQ96GA7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDSLQ96GA7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSLQ96GA7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSLQ96GA7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSLQ96GA7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSLQ96GA7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDSLQ96GA7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDSLQ96GA7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDSLQ96GA7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDSLQ96GA7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDSLQ96GA7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDSLQ96GA7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDSLQ96GA7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDSLQ96GA7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDSLQ96GA7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSLQ96GA7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSLQ96GA7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSLQ96GA7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDSLQ96GA7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDSLQ96GA7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDSLQ96GA7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDSLQ96GA7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SDSLQ96GA7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSLQ96GA7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSLQ96GA7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDSLQ96GA7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDSLQ96GA7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDSLQ96GA7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDSLQ96GA7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDSLQ96GA7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDSLQ96GA7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDSLQ96GA7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDSLQ96GA7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDSLQ96GA7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDSLQ96GA7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDSLQ96GA7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDSLQ96GA7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SDSLQ96GA7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDSLQ96GA7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDSLQ96GA7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDSLQ96GA7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDSLQ96GA7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDSLQ96GA7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDSLQ96GA7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDSLQ96GA7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDSLQ96GA7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSLQ96GA7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSLQ96GA7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSLQ96GA7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSLQ96GA7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSLQ96GA7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSLQ96GA7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSLQ96GA7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSLQ96GA7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDSLQ96GA7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDSLQ96GA7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDSLQ96GA7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDSLQ96GA7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDSLQ96GA7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDSLQ96GA7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSLQ96GA7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSLQ96GA7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSLQ96GA7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDSLQ96GA7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDSLQ96GA7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDSLQ96GA7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDSLQ96GA7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDSLQ96GA7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDSLQ96GA7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDSLQ96GA7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDSLQ96GA7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDSLQ96GA7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDSLQ96GA7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDSLQ96GA7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDSLQ96GA7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDSLQ96GA7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDSLQ96GA7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDSLQ96GA7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDSLQ96GA7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms