Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CYFIP2Q96F07 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CYFIP2Q96F07 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CYFIP2Q96F07 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CYFIP2Q96F07 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CYFIP2Q96F07 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CYFIP2Q96F07 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CYFIP2Q96F07 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CYFIP2Q96F07 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CYFIP2Q96F07 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CYFIP2Q96F07 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CYFIP2Q96F07 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CYFIP2Q96F07 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CYFIP2Q96F07 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CYFIP2Q96F07 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CYFIP2Q96F07 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CYFIP2Q96F07 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CYFIP2Q96F07 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CYFIP2Q96F07 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CYFIP2Q96F07 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CYFIP2Q96F07 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CYFIP2Q96F07 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CYFIP2Q96F07 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CYFIP2Q96F07 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CYFIP2Q96F07 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CYFIP2Q96F07 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CYFIP2Q96F07 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CYFIP2Q96F07 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CYFIP2Q96F07 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CYFIP2Q96F07 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CYFIP2Q96F07 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CYFIP2Q96F07 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CYFIP2Q96F07 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CYFIP2Q96F07 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CYFIP2Q96F07 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CYFIP2Q96F07 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CYFIP2Q96F07 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CYFIP2Q96F07 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CYFIP2Q96F07 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CYFIP2Q96F07 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CYFIP2Q96F07 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CYFIP2Q96F07 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CYFIP2Q96F07 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CYFIP2Q96F07 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CYFIP2Q96F07 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CYFIP2Q96F07 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CYFIP2Q96F07 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CYFIP2Q96F07 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CYFIP2Q96F07 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CYFIP2Q96F07 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CYFIP2Q96F07 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CYFIP2Q96F07 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CYFIP2Q96F07 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CYFIP2Q96F07 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CYFIP2Q96F07 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CYFIP2Q96F07 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CYFIP2Q96F07 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CYFIP2Q96F07 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CYFIP2Q96F07 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CYFIP2Q96F07 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CYFIP2Q96F07 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CYFIP2Q96F07 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CYFIP2Q96F07 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CYFIP2Q96F07 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CYFIP2Q96F07 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CYFIP2Q96F07 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CYFIP2Q96F07 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CYFIP2Q96F07 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CYFIP2Q96F07 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CYFIP2Q96F07 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CYFIP2Q96F07 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CYFIP2Q96F07 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CYFIP2Q96F07 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CYFIP2Q96F07 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CYFIP2Q96F07 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CYFIP2Q96F07 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CYFIP2Q96F07 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CYFIP2Q96F07 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CYFIP2Q96F07 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CYFIP2Q96F07 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CYFIP2Q96F07 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CYFIP2Q96F07 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms