Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CYFIP2Q96F07 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CYFIP2Q96F07 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CYFIP2Q96F07 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CYFIP2Q96F07 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CYFIP2Q96F07 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CYFIP2Q96F07 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
CYFIP2Q96F07 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CYFIP2Q96F07 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CYFIP2Q96F07 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CYFIP2Q96F07 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CYFIP2Q96F07 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CYFIP2Q96F07 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CYFIP2Q96F07 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CYFIP2Q96F07 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CYFIP2Q96F07 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CYFIP2Q96F07 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CYFIP2Q96F07 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CYFIP2Q96F07 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CYFIP2Q96F07 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CYFIP2Q96F07 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CYFIP2Q96F07 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CYFIP2Q96F07 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CYFIP2Q96F07 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CYFIP2Q96F07 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CYFIP2Q96F07 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CYFIP2Q96F07 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CYFIP2Q96F07 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CYFIP2Q96F07 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CYFIP2Q96F07 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CYFIP2Q96F07 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CYFIP2Q96F07 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CYFIP2Q96F07 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CYFIP2Q96F07 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CYFIP2Q96F07 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CYFIP2Q96F07 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CYFIP2Q96F07 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CYFIP2Q96F07 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CYFIP2Q96F07 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CYFIP2Q96F07 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CYFIP2Q96F07 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CYFIP2Q96F07 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CYFIP2Q96F07 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CYFIP2Q96F07 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CYFIP2Q96F07 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CYFIP2Q96F07 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CYFIP2Q96F07 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CYFIP2Q96F07 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CYFIP2Q96F07 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CYFIP2Q96F07 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CYFIP2Q96F07 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CYFIP2Q96F07 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CYFIP2Q96F07 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CYFIP2Q96F07 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CYFIP2Q96F07 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CYFIP2Q96F07 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CYFIP2Q96F07 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CYFIP2Q96F07 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CYFIP2Q96F07 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CYFIP2Q96F07 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CYFIP2Q96F07 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CYFIP2Q96F07 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CYFIP2Q96F07 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CYFIP2Q96F07 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CYFIP2Q96F07 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CYFIP2Q96F07 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CYFIP2Q96F07 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CYFIP2Q96F07 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CYFIP2Q96F07 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CYFIP2Q96F07 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CYFIP2Q96F07 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CYFIP2Q96F07 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CYFIP2Q96F07 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CYFIP2Q96F07 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CYFIP2Q96F07 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CYFIP2Q96F07 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CYFIP2Q96F07 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CYFIP2Q96F07 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CYFIP2Q96F07 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CYFIP2Q96F07 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CYFIP2Q96F07 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CYFIP2Q96F07 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CYFIP2Q96F07 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
CYFIP2Q96F07 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
CYFIP2Q96F07 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CYFIP2Q96F07 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CYFIP2Q96F07 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CYFIP2Q96F07 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CYFIP2Q96F07 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CYFIP2Q96F07 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CYFIP2Q96F07 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CYFIP2Q96F07 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CYFIP2Q96F07 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CYFIP2Q96F07 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CYFIP2Q96F07 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CYFIP2Q96F07 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CYFIP2Q96F07 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CYFIP2Q96F07 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CYFIP2Q96F07 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CYFIP2Q96F07 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms