Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDCCAG3Q96C92 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDCCAG3Q96C92 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDCCAG3Q96C92 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SDCCAG3Q96C92 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SDCCAG3Q96C92 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SDCCAG3Q96C92 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SDCCAG3Q96C92 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SDCCAG3Q96C92 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SDCCAG3Q96C92 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDCCAG3Q96C92 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDCCAG3Q96C92 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDCCAG3Q96C92 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SDCCAG3Q96C92 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SDCCAG3Q96C92 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SDCCAG3Q96C92 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SDCCAG3Q96C92 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SDCCAG3Q96C92 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SDCCAG3Q96C92 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SDCCAG3Q96C92 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SDCCAG3Q96C92 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SDCCAG3Q96C92 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SDCCAG3Q96C92 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SDCCAG3Q96C92 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SDCCAG3Q96C92 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SDCCAG3Q96C92 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SDCCAG3Q96C92 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SDCCAG3Q96C92 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SDCCAG3Q96C92 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SDCCAG3Q96C92 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SDCCAG3Q96C92 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SDCCAG3Q96C92 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SDCCAG3Q96C92 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDCCAG3Q96C92 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDCCAG3Q96C92 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDCCAG3Q96C92 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDCCAG3Q96C92 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDCCAG3Q96C92 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDCCAG3Q96C92 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDCCAG3Q96C92 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDCCAG3Q96C92 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SDCCAG3Q96C92 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SDCCAG3Q96C92 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SDCCAG3Q96C92 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SDCCAG3Q96C92 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDCCAG3Q96C92 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDCCAG3Q96C92 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDCCAG3Q96C92 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDCCAG3Q96C92 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDCCAG3Q96C92 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDCCAG3Q96C92 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDCCAG3Q96C92 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDCCAG3Q96C92 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDCCAG3Q96C92 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDCCAG3Q96C92 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDCCAG3Q96C92 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDCCAG3Q96C92 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDCCAG3Q96C92 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDCCAG3Q96C92 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDCCAG3Q96C92 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDCCAG3Q96C92 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDCCAG3Q96C92 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SDCCAG3Q96C92 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SDCCAG3Q96C92 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDCCAG3Q96C92 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDCCAG3Q96C92 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDCCAG3Q96C92 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDCCAG3Q96C92 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDCCAG3Q96C92 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDCCAG3Q96C92 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDCCAG3Q96C92 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SDCCAG3Q96C92 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SDCCAG3Q96C92 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SDCCAG3Q96C92 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SDCCAG3Q96C92 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDCCAG3Q96C92 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDCCAG3Q96C92 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDCCAG3Q96C92 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDCCAG3Q96C92 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDCCAG3Q96C92 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDCCAG3Q96C92 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDCCAG3Q96C92 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDCCAG3Q96C92 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDCCAG3Q96C92 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SDCCAG3Q96C92 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDCCAG3Q96C92 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDCCAG3Q96C92 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDCCAG3Q96C92 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDCCAG3Q96C92 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDCCAG3Q96C92 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDCCAG3Q96C92 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDCCAG3Q96C92 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDCCAG3Q96C92 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SDCCAG3Q96C92 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SDCCAG3Q96C92 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SDCCAG3Q96C92 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDCCAG3Q96C92 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDCCAG3Q96C92 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SDCCAG3Q96C92 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SDCCAG3Q96C92 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms