Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SDCCAG3Q96C92 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SDCCAG3Q96C92 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SDCCAG3Q96C92 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SDCCAG3Q96C92 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SDCCAG3Q96C92 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SDCCAG3Q96C92 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SDCCAG3Q96C92 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SDCCAG3Q96C92 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SDCCAG3Q96C92 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SDCCAG3Q96C92 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SDCCAG3Q96C92 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SDCCAG3Q96C92 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SDCCAG3Q96C92 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SDCCAG3Q96C92 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SDCCAG3Q96C92 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SDCCAG3Q96C92 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SDCCAG3Q96C92 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SDCCAG3Q96C92 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SDCCAG3Q96C92 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SDCCAG3Q96C92 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SDCCAG3Q96C92 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SDCCAG3Q96C92 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SDCCAG3Q96C92 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SDCCAG3Q96C92 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SDCCAG3Q96C92 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SDCCAG3Q96C92 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SDCCAG3Q96C92 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SDCCAG3Q96C92 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SDCCAG3Q96C92 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SDCCAG3Q96C92 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SDCCAG3Q96C92 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SDCCAG3Q96C92 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SDCCAG3Q96C92 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SDCCAG3Q96C92 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SDCCAG3Q96C92 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SDCCAG3Q96C92 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SDCCAG3Q96C92 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SDCCAG3Q96C92 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SDCCAG3Q96C92 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SDCCAG3Q96C92 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SDCCAG3Q96C92 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SDCCAG3Q96C92 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SDCCAG3Q96C92 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SDCCAG3Q96C92 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SDCCAG3Q96C92 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SDCCAG3Q96C92 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SDCCAG3Q96C92 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SDCCAG3Q96C92 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SDCCAG3Q96C92 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SDCCAG3Q96C92 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SDCCAG3Q96C92 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SDCCAG3Q96C92 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SDCCAG3Q96C92 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SDCCAG3Q96C92 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SDCCAG3Q96C92 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SDCCAG3Q96C92 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SDCCAG3Q96C92 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SDCCAG3Q96C92 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SDCCAG3Q96C92 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SDCCAG3Q96C92 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SDCCAG3Q96C92 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SDCCAG3Q96C92 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SDCCAG3Q96C92 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SDCCAG3Q96C92 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SDCCAG3Q96C92 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SDCCAG3Q96C92 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SDCCAG3Q96C92 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SDCCAG3Q96C92 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SDCCAG3Q96C92 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SDCCAG3Q96C92 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SDCCAG3Q96C92 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SDCCAG3Q96C92 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SDCCAG3Q96C92 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SDCCAG3Q96C92 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SDCCAG3Q96C92 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SDCCAG3Q96C92 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SDCCAG3Q96C92 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SDCCAG3Q96C92 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SDCCAG3Q96C92 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SDCCAG3Q96C92 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SDCCAG3Q96C92 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SDCCAG3Q96C92 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SDCCAG3Q96C92 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SDCCAG3Q96C92 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SDCCAG3Q96C92 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SDCCAG3Q96C92 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SDCCAG3Q96C92 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SDCCAG3Q96C92 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SDCCAG3Q96C92 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SDCCAG3Q96C92 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SDCCAG3Q96C92 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SDCCAG3Q96C92 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SDCCAG3Q96C92 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SDCCAG3Q96C92 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SDCCAG3Q96C92 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SDCCAG3Q96C92 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDCCAG3Q96C92 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SDCCAG3Q96C92 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SDCCAG3Q96C92 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms