Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EFHD2Q96C19 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EFHD2Q96C19 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EFHD2Q96C19 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EFHD2Q96C19 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EFHD2Q96C19 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EFHD2Q96C19 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EFHD2Q96C19 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EFHD2Q96C19 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EFHD2Q96C19 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EFHD2Q96C19 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EFHD2Q96C19 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EFHD2Q96C19 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EFHD2Q96C19 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EFHD2Q96C19 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFHD2Q96C19 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EFHD2Q96C19 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EFHD2Q96C19 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EFHD2Q96C19 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EFHD2Q96C19 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EFHD2Q96C19 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EFHD2Q96C19 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EFHD2Q96C19 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EFHD2Q96C19 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EFHD2Q96C19 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EFHD2Q96C19 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EFHD2Q96C19 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EFHD2Q96C19 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EFHD2Q96C19 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EFHD2Q96C19 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EFHD2Q96C19 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EFHD2Q96C19 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFHD2Q96C19 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFHD2Q96C19 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFHD2Q96C19 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFHD2Q96C19 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EFHD2Q96C19 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EFHD2Q96C19 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EFHD2Q96C19 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EFHD2Q96C19 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EFHD2Q96C19 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EFHD2Q96C19 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFHD2Q96C19 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFHD2Q96C19 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EFHD2Q96C19 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFHD2Q96C19 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFHD2Q96C19 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFHD2Q96C19 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFHD2Q96C19 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EFHD2Q96C19 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EFHD2Q96C19 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFHD2Q96C19 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFHD2Q96C19 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EFHD2Q96C19 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EFHD2Q96C19 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EFHD2Q96C19 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EFHD2Q96C19 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EFHD2Q96C19 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFHD2Q96C19 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFHD2Q96C19 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFHD2Q96C19 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFHD2Q96C19 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFHD2Q96C19 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
EFHD2Q96C19 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
EFHD2Q96C19 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EFHD2Q96C19 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFHD2Q96C19 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFHD2Q96C19 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFHD2Q96C19 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFHD2Q96C19 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFHD2Q96C19 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFHD2Q96C19 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFHD2Q96C19 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFHD2Q96C19 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFHD2Q96C19 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EFHD2Q96C19 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EFHD2Q96C19 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFHD2Q96C19 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EFHD2Q96C19 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFHD2Q96C19 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFHD2Q96C19 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFHD2Q96C19 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFHD2Q96C19 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EFHD2Q96C19 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFHD2Q96C19 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFHD2Q96C19 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFHD2Q96C19 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFHD2Q96C19 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFHD2Q96C19 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFHD2Q96C19 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFHD2Q96C19 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFHD2Q96C19 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFHD2Q96C19 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFHD2Q96C19 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFHD2Q96C19 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFHD2Q96C19 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFHD2Q96C19 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFHD2Q96C19 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFHD2Q96C19 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFHD2Q96C19 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms