Protein–RNA interactions for Protein: Q969X5

ERGIC1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC1Q969X5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERGIC1Q969X5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERGIC1Q969X5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERGIC1Q969X5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERGIC1Q969X5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERGIC1Q969X5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERGIC1Q969X5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERGIC1Q969X5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERGIC1Q969X5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERGIC1Q969X5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERGIC1Q969X5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERGIC1Q969X5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERGIC1Q969X5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERGIC1Q969X5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERGIC1Q969X5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERGIC1Q969X5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERGIC1Q969X5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERGIC1Q969X5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERGIC1Q969X5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERGIC1Q969X5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERGIC1Q969X5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERGIC1Q969X5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERGIC1Q969X5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERGIC1Q969X5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERGIC1Q969X5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERGIC1Q969X5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERGIC1Q969X5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERGIC1Q969X5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERGIC1Q969X5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERGIC1Q969X5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERGIC1Q969X5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERGIC1Q969X5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERGIC1Q969X5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERGIC1Q969X5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERGIC1Q969X5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERGIC1Q969X5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERGIC1Q969X5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERGIC1Q969X5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERGIC1Q969X5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERGIC1Q969X5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERGIC1Q969X5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERGIC1Q969X5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERGIC1Q969X5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERGIC1Q969X5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERGIC1Q969X5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERGIC1Q969X5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERGIC1Q969X5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERGIC1Q969X5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERGIC1Q969X5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERGIC1Q969X5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERGIC1Q969X5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERGIC1Q969X5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERGIC1Q969X5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERGIC1Q969X5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERGIC1Q969X5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERGIC1Q969X5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERGIC1Q969X5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERGIC1Q969X5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERGIC1Q969X5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERGIC1Q969X5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERGIC1Q969X5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERGIC1Q969X5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERGIC1Q969X5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERGIC1Q969X5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERGIC1Q969X5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERGIC1Q969X5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERGIC1Q969X5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERGIC1Q969X5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERGIC1Q969X5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERGIC1Q969X5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERGIC1Q969X5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERGIC1Q969X5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERGIC1Q969X5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERGIC1Q969X5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERGIC1Q969X5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERGIC1Q969X5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERGIC1Q969X5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERGIC1Q969X5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERGIC1Q969X5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERGIC1Q969X5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERGIC1Q969X5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERGIC1Q969X5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERGIC1Q969X5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERGIC1Q969X5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERGIC1Q969X5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ERGIC1Q969X5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERGIC1Q969X5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERGIC1Q969X5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERGIC1Q969X5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERGIC1Q969X5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERGIC1Q969X5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERGIC1Q969X5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERGIC1Q969X5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERGIC1Q969X5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERGIC1Q969X5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERGIC1Q969X5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERGIC1Q969X5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERGIC1Q969X5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ERGIC1Q969X5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERGIC1Q969X5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms