Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CLDN19Q8N6F1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLDN19Q8N6F1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLDN19Q8N6F1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLDN19Q8N6F1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLDN19Q8N6F1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLDN19Q8N6F1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLDN19Q8N6F1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLDN19Q8N6F1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLDN19Q8N6F1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLDN19Q8N6F1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLDN19Q8N6F1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLDN19Q8N6F1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLDN19Q8N6F1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLDN19Q8N6F1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLDN19Q8N6F1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLDN19Q8N6F1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLDN19Q8N6F1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLDN19Q8N6F1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLDN19Q8N6F1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLDN19Q8N6F1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLDN19Q8N6F1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLDN19Q8N6F1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLDN19Q8N6F1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLDN19Q8N6F1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLDN19Q8N6F1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLDN19Q8N6F1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLDN19Q8N6F1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLDN19Q8N6F1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLDN19Q8N6F1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLDN19Q8N6F1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLDN19Q8N6F1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLDN19Q8N6F1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLDN19Q8N6F1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLDN19Q8N6F1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLDN19Q8N6F1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLDN19Q8N6F1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLDN19Q8N6F1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLDN19Q8N6F1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLDN19Q8N6F1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLDN19Q8N6F1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLDN19Q8N6F1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLDN19Q8N6F1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLDN19Q8N6F1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLDN19Q8N6F1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLDN19Q8N6F1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLDN19Q8N6F1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLDN19Q8N6F1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLDN19Q8N6F1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLDN19Q8N6F1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLDN19Q8N6F1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLDN19Q8N6F1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLDN19Q8N6F1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLDN19Q8N6F1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLDN19Q8N6F1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLDN19Q8N6F1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLDN19Q8N6F1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CLDN19Q8N6F1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLDN19Q8N6F1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLDN19Q8N6F1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLDN19Q8N6F1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLDN19Q8N6F1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLDN19Q8N6F1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLDN19Q8N6F1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLDN19Q8N6F1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CLDN19Q8N6F1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLDN19Q8N6F1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLDN19Q8N6F1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLDN19Q8N6F1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLDN19Q8N6F1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLDN19Q8N6F1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLDN19Q8N6F1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLDN19Q8N6F1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLDN19Q8N6F1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLDN19Q8N6F1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLDN19Q8N6F1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLDN19Q8N6F1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLDN19Q8N6F1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLDN19Q8N6F1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDN19Q8N6F1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDN19Q8N6F1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDN19Q8N6F1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDN19Q8N6F1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CLDN19Q8N6F1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLDN19Q8N6F1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDN19Q8N6F1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDN19Q8N6F1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLDN19Q8N6F1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN19Q8N6F1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLDN19Q8N6F1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN19Q8N6F1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN19Q8N6F1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN19Q8N6F1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDN19Q8N6F1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDN19Q8N6F1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN19Q8N6F1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLDN19Q8N6F1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLDN19Q8N6F1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLDN19Q8N6F1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDN19Q8N6F1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
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