Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VSIG1Q86XK7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VSIG1Q86XK7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VSIG1Q86XK7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VSIG1Q86XK7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VSIG1Q86XK7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VSIG1Q86XK7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VSIG1Q86XK7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VSIG1Q86XK7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VSIG1Q86XK7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VSIG1Q86XK7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
VSIG1Q86XK7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VSIG1Q86XK7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VSIG1Q86XK7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VSIG1Q86XK7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VSIG1Q86XK7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VSIG1Q86XK7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VSIG1Q86XK7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VSIG1Q86XK7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VSIG1Q86XK7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VSIG1Q86XK7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VSIG1Q86XK7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VSIG1Q86XK7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VSIG1Q86XK7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VSIG1Q86XK7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VSIG1Q86XK7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VSIG1Q86XK7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
VSIG1Q86XK7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VSIG1Q86XK7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VSIG1Q86XK7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VSIG1Q86XK7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VSIG1Q86XK7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VSIG1Q86XK7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VSIG1Q86XK7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VSIG1Q86XK7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VSIG1Q86XK7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VSIG1Q86XK7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VSIG1Q86XK7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VSIG1Q86XK7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VSIG1Q86XK7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VSIG1Q86XK7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
VSIG1Q86XK7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
VSIG1Q86XK7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VSIG1Q86XK7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VSIG1Q86XK7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VSIG1Q86XK7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VSIG1Q86XK7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VSIG1Q86XK7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VSIG1Q86XK7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VSIG1Q86XK7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
VSIG1Q86XK7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VSIG1Q86XK7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VSIG1Q86XK7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VSIG1Q86XK7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VSIG1Q86XK7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VSIG1Q86XK7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VSIG1Q86XK7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VSIG1Q86XK7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VSIG1Q86XK7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VSIG1Q86XK7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VSIG1Q86XK7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VSIG1Q86XK7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VSIG1Q86XK7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VSIG1Q86XK7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VSIG1Q86XK7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VSIG1Q86XK7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VSIG1Q86XK7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VSIG1Q86XK7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VSIG1Q86XK7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VSIG1Q86XK7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VSIG1Q86XK7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VSIG1Q86XK7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VSIG1Q86XK7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VSIG1Q86XK7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VSIG1Q86XK7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VSIG1Q86XK7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VSIG1Q86XK7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VSIG1Q86XK7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VSIG1Q86XK7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VSIG1Q86XK7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VSIG1Q86XK7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VSIG1Q86XK7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VSIG1Q86XK7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VSIG1Q86XK7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VSIG1Q86XK7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VSIG1Q86XK7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VSIG1Q86XK7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VSIG1Q86XK7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VSIG1Q86XK7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VSIG1Q86XK7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VSIG1Q86XK7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VSIG1Q86XK7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VSIG1Q86XK7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VSIG1Q86XK7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VSIG1Q86XK7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VSIG1Q86XK7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VSIG1Q86XK7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VSIG1Q86XK7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
VSIG1Q86XK7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VSIG1Q86XK7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms