Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX20Q7Z614 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX20Q7Z614 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX20Q7Z614 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX20Q7Z614 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX20Q7Z614 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX20Q7Z614 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX20Q7Z614 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX20Q7Z614 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX20Q7Z614 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SNX20Q7Z614 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX20Q7Z614 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX20Q7Z614 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX20Q7Z614 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX20Q7Z614 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX20Q7Z614 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX20Q7Z614 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX20Q7Z614 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX20Q7Z614 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX20Q7Z614 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX20Q7Z614 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX20Q7Z614 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNX20Q7Z614 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SNX20Q7Z614 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SNX20Q7Z614 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SNX20Q7Z614 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SNX20Q7Z614 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNX20Q7Z614 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SNX20Q7Z614 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX20Q7Z614 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX20Q7Z614 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX20Q7Z614 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNX20Q7Z614 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX20Q7Z614 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX20Q7Z614 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX20Q7Z614 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX20Q7Z614 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX20Q7Z614 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX20Q7Z614 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX20Q7Z614 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX20Q7Z614 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX20Q7Z614 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX20Q7Z614 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX20Q7Z614 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX20Q7Z614 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX20Q7Z614 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX20Q7Z614 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SNX20Q7Z614 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX20Q7Z614 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX20Q7Z614 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX20Q7Z614 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX20Q7Z614 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX20Q7Z614 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX20Q7Z614 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX20Q7Z614 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX20Q7Z614 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX20Q7Z614 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX20Q7Z614 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX20Q7Z614 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX20Q7Z614 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX20Q7Z614 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX20Q7Z614 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX20Q7Z614 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX20Q7Z614 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX20Q7Z614 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX20Q7Z614 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX20Q7Z614 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX20Q7Z614 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX20Q7Z614 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX20Q7Z614 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX20Q7Z614 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX20Q7Z614 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX20Q7Z614 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX20Q7Z614 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX20Q7Z614 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SNX20Q7Z614 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SNX20Q7Z614 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX20Q7Z614 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX20Q7Z614 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX20Q7Z614 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX20Q7Z614 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX20Q7Z614 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX20Q7Z614 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX20Q7Z614 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX20Q7Z614 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX20Q7Z614 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX20Q7Z614 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX20Q7Z614 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX20Q7Z614 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX20Q7Z614 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX20Q7Z614 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX20Q7Z614 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX20Q7Z614 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX20Q7Z614 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX20Q7Z614 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX20Q7Z614 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX20Q7Z614 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX20Q7Z614 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX20Q7Z614 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNX20Q7Z614 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms