Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4H3

HDDC2, HD domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC2Q7Z4H3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDDC2Q7Z4H3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDDC2Q7Z4H3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDDC2Q7Z4H3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDDC2Q7Z4H3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDDC2Q7Z4H3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDDC2Q7Z4H3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDDC2Q7Z4H3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDDC2Q7Z4H3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDDC2Q7Z4H3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDDC2Q7Z4H3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HDDC2Q7Z4H3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDDC2Q7Z4H3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HDDC2Q7Z4H3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDDC2Q7Z4H3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDDC2Q7Z4H3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDDC2Q7Z4H3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDDC2Q7Z4H3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDDC2Q7Z4H3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDDC2Q7Z4H3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDDC2Q7Z4H3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDDC2Q7Z4H3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDDC2Q7Z4H3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDDC2Q7Z4H3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDDC2Q7Z4H3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDDC2Q7Z4H3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDDC2Q7Z4H3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDDC2Q7Z4H3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDDC2Q7Z4H3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDDC2Q7Z4H3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDDC2Q7Z4H3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDDC2Q7Z4H3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDDC2Q7Z4H3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDDC2Q7Z4H3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDDC2Q7Z4H3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDDC2Q7Z4H3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDDC2Q7Z4H3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDDC2Q7Z4H3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDDC2Q7Z4H3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDDC2Q7Z4H3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDDC2Q7Z4H3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HDDC2Q7Z4H3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDDC2Q7Z4H3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDDC2Q7Z4H3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDDC2Q7Z4H3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDDC2Q7Z4H3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDDC2Q7Z4H3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDDC2Q7Z4H3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDDC2Q7Z4H3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDDC2Q7Z4H3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDDC2Q7Z4H3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDDC2Q7Z4H3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDDC2Q7Z4H3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDDC2Q7Z4H3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDDC2Q7Z4H3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDDC2Q7Z4H3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDDC2Q7Z4H3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDDC2Q7Z4H3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDDC2Q7Z4H3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDDC2Q7Z4H3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDDC2Q7Z4H3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDDC2Q7Z4H3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDDC2Q7Z4H3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDDC2Q7Z4H3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDDC2Q7Z4H3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDDC2Q7Z4H3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDDC2Q7Z4H3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDDC2Q7Z4H3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDDC2Q7Z4H3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDDC2Q7Z4H3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDDC2Q7Z4H3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDDC2Q7Z4H3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDDC2Q7Z4H3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDDC2Q7Z4H3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDDC2Q7Z4H3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDDC2Q7Z4H3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDDC2Q7Z4H3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDDC2Q7Z4H3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDDC2Q7Z4H3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDDC2Q7Z4H3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDDC2Q7Z4H3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDDC2Q7Z4H3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDDC2Q7Z4H3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDDC2Q7Z4H3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDDC2Q7Z4H3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDDC2Q7Z4H3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDDC2Q7Z4H3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HDDC2Q7Z4H3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDDC2Q7Z4H3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDDC2Q7Z4H3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDDC2Q7Z4H3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDDC2Q7Z4H3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDDC2Q7Z4H3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDDC2Q7Z4H3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDDC2Q7Z4H3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDDC2Q7Z4H3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDDC2Q7Z4H3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDDC2Q7Z4H3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDDC2Q7Z4H3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDDC2Q7Z4H3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms