Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ATF7IPQ6VMQ6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ATF7IPQ6VMQ6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
ATF7IPQ6VMQ6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ATF7IPQ6VMQ6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ATF7IPQ6VMQ6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ATF7IPQ6VMQ6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ATF7IPQ6VMQ6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ATF7IPQ6VMQ6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ATF7IPQ6VMQ6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ATF7IPQ6VMQ6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ATF7IPQ6VMQ6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ATF7IPQ6VMQ6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ATF7IPQ6VMQ6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ATF7IPQ6VMQ6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ATF7IPQ6VMQ6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ATF7IPQ6VMQ6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ATF7IPQ6VMQ6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ATF7IPQ6VMQ6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ATF7IPQ6VMQ6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ATF7IPQ6VMQ6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ATF7IPQ6VMQ6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ATF7IPQ6VMQ6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ATF7IPQ6VMQ6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ATF7IPQ6VMQ6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ATF7IPQ6VMQ6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ATF7IPQ6VMQ6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ATF7IPQ6VMQ6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ATF7IPQ6VMQ6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ATF7IPQ6VMQ6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ATF7IPQ6VMQ6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ATF7IPQ6VMQ6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ATF7IPQ6VMQ6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ATF7IPQ6VMQ6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ATF7IPQ6VMQ6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ATF7IPQ6VMQ6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ATF7IPQ6VMQ6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ATF7IPQ6VMQ6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.22
ATF7IPQ6VMQ6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ATF7IPQ6VMQ6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ATF7IPQ6VMQ6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ATF7IPQ6VMQ6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ATF7IPQ6VMQ6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ATF7IPQ6VMQ6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ATF7IPQ6VMQ6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ATF7IPQ6VMQ6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ATF7IPQ6VMQ6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ATF7IPQ6VMQ6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ATF7IPQ6VMQ6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ATF7IPQ6VMQ6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ATF7IPQ6VMQ6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
ATF7IPQ6VMQ6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
ATF7IPQ6VMQ6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ATF7IPQ6VMQ6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ATF7IPQ6VMQ6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ATF7IPQ6VMQ6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ATF7IPQ6VMQ6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ATF7IPQ6VMQ6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ATF7IPQ6VMQ6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ATF7IPQ6VMQ6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ATF7IPQ6VMQ6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ATF7IPQ6VMQ6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ATF7IPQ6VMQ6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ATF7IPQ6VMQ6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ATF7IPQ6VMQ6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ATF7IPQ6VMQ6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ATF7IPQ6VMQ6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATF7IPQ6VMQ6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATF7IPQ6VMQ6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ATF7IPQ6VMQ6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ATF7IPQ6VMQ6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ATF7IPQ6VMQ6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ATF7IPQ6VMQ6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ATF7IPQ6VMQ6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ATF7IPQ6VMQ6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ATF7IPQ6VMQ6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATF7IPQ6VMQ6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATF7IPQ6VMQ6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ATF7IPQ6VMQ6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ATF7IPQ6VMQ6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ATF7IPQ6VMQ6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ATF7IPQ6VMQ6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATF7IPQ6VMQ6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ATF7IPQ6VMQ6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ATF7IPQ6VMQ6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ATF7IPQ6VMQ6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ATF7IPQ6VMQ6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ATF7IPQ6VMQ6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ATF7IPQ6VMQ6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ATF7IPQ6VMQ6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ATF7IPQ6VMQ6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ATF7IPQ6VMQ6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ATF7IPQ6VMQ6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
ATF7IPQ6VMQ6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ATF7IPQ6VMQ6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ATF7IPQ6VMQ6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ATF7IPQ6VMQ6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ATF7IPQ6VMQ6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms