Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG9

LRFN4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN4Q6PJG9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRFN4Q6PJG9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRFN4Q6PJG9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRFN4Q6PJG9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRFN4Q6PJG9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRFN4Q6PJG9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN4Q6PJG9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN4Q6PJG9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN4Q6PJG9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRFN4Q6PJG9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRFN4Q6PJG9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRFN4Q6PJG9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRFN4Q6PJG9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRFN4Q6PJG9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRFN4Q6PJG9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRFN4Q6PJG9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRFN4Q6PJG9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRFN4Q6PJG9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRFN4Q6PJG9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRFN4Q6PJG9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN4Q6PJG9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN4Q6PJG9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN4Q6PJG9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRFN4Q6PJG9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN4Q6PJG9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN4Q6PJG9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN4Q6PJG9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRFN4Q6PJG9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRFN4Q6PJG9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRFN4Q6PJG9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRFN4Q6PJG9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRFN4Q6PJG9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRFN4Q6PJG9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRFN4Q6PJG9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRFN4Q6PJG9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRFN4Q6PJG9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRFN4Q6PJG9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRFN4Q6PJG9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRFN4Q6PJG9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRFN4Q6PJG9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRFN4Q6PJG9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRFN4Q6PJG9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRFN4Q6PJG9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN4Q6PJG9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRFN4Q6PJG9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRFN4Q6PJG9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRFN4Q6PJG9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRFN4Q6PJG9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRFN4Q6PJG9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRFN4Q6PJG9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRFN4Q6PJG9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRFN4Q6PJG9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRFN4Q6PJG9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRFN4Q6PJG9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRFN4Q6PJG9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRFN4Q6PJG9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRFN4Q6PJG9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRFN4Q6PJG9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRFN4Q6PJG9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN4Q6PJG9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN4Q6PJG9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN4Q6PJG9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN4Q6PJG9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRFN4Q6PJG9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRFN4Q6PJG9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRFN4Q6PJG9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRFN4Q6PJG9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRFN4Q6PJG9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN4Q6PJG9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRFN4Q6PJG9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRFN4Q6PJG9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRFN4Q6PJG9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN4Q6PJG9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN4Q6PJG9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN4Q6PJG9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN4Q6PJG9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN4Q6PJG9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN4Q6PJG9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN4Q6PJG9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN4Q6PJG9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRFN4Q6PJG9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRFN4Q6PJG9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRFN4Q6PJG9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRFN4Q6PJG9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRFN4Q6PJG9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRFN4Q6PJG9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRFN4Q6PJG9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN4Q6PJG9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRFN4Q6PJG9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRFN4Q6PJG9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN4Q6PJG9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN4Q6PJG9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN4Q6PJG9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN4Q6PJG9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN4Q6PJG9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN4Q6PJG9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRFN4Q6PJG9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRFN4Q6PJG9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN4Q6PJG9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN4Q6PJG9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms