Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2Q4

CCNYL2, Cyclin-Y-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL2Q5T2Q4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNYL2Q5T2Q4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNYL2Q5T2Q4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCNYL2Q5T2Q4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNYL2Q5T2Q4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNYL2Q5T2Q4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNYL2Q5T2Q4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCNYL2Q5T2Q4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCNYL2Q5T2Q4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCNYL2Q5T2Q4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNYL2Q5T2Q4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCNYL2Q5T2Q4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCNYL2Q5T2Q4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCNYL2Q5T2Q4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCNYL2Q5T2Q4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCNYL2Q5T2Q4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCNYL2Q5T2Q4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNYL2Q5T2Q4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNYL2Q5T2Q4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNYL2Q5T2Q4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNYL2Q5T2Q4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNYL2Q5T2Q4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNYL2Q5T2Q4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNYL2Q5T2Q4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNYL2Q5T2Q4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNYL2Q5T2Q4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNYL2Q5T2Q4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCNYL2Q5T2Q4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCNYL2Q5T2Q4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCNYL2Q5T2Q4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNYL2Q5T2Q4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNYL2Q5T2Q4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNYL2Q5T2Q4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNYL2Q5T2Q4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNYL2Q5T2Q4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCNYL2Q5T2Q4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCNYL2Q5T2Q4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCNYL2Q5T2Q4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCNYL2Q5T2Q4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCNYL2Q5T2Q4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCNYL2Q5T2Q4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNYL2Q5T2Q4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNYL2Q5T2Q4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNYL2Q5T2Q4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNYL2Q5T2Q4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNYL2Q5T2Q4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCNYL2Q5T2Q4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCNYL2Q5T2Q4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCNYL2Q5T2Q4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCNYL2Q5T2Q4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCNYL2Q5T2Q4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNYL2Q5T2Q4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNYL2Q5T2Q4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCNYL2Q5T2Q4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCNYL2Q5T2Q4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCNYL2Q5T2Q4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCNYL2Q5T2Q4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCNYL2Q5T2Q4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCNYL2Q5T2Q4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCNYL2Q5T2Q4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCNYL2Q5T2Q4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCNYL2Q5T2Q4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCNYL2Q5T2Q4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCNYL2Q5T2Q4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCNYL2Q5T2Q4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCNYL2Q5T2Q4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCNYL2Q5T2Q4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCNYL2Q5T2Q4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCNYL2Q5T2Q4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNYL2Q5T2Q4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNYL2Q5T2Q4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNYL2Q5T2Q4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNYL2Q5T2Q4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNYL2Q5T2Q4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNYL2Q5T2Q4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNYL2Q5T2Q4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNYL2Q5T2Q4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNYL2Q5T2Q4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNYL2Q5T2Q4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNYL2Q5T2Q4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNYL2Q5T2Q4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNYL2Q5T2Q4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNYL2Q5T2Q4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNYL2Q5T2Q4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNYL2Q5T2Q4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNYL2Q5T2Q4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNYL2Q5T2Q4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNYL2Q5T2Q4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNYL2Q5T2Q4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNYL2Q5T2Q4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNYL2Q5T2Q4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNYL2Q5T2Q4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNYL2Q5T2Q4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNYL2Q5T2Q4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNYL2Q5T2Q4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNYL2Q5T2Q4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNYL2Q5T2Q4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms