Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2Q4

CCNYL2, Cyclin-Y-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL2Q5T2Q4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCNYL2Q5T2Q4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCNYL2Q5T2Q4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
CCNYL2Q5T2Q4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCNYL2Q5T2Q4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCNYL2Q5T2Q4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCNYL2Q5T2Q4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCNYL2Q5T2Q4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCNYL2Q5T2Q4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCNYL2Q5T2Q4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCNYL2Q5T2Q4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCNYL2Q5T2Q4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCNYL2Q5T2Q4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCNYL2Q5T2Q4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCNYL2Q5T2Q4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCNYL2Q5T2Q4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCNYL2Q5T2Q4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCNYL2Q5T2Q4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCNYL2Q5T2Q4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCNYL2Q5T2Q4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCNYL2Q5T2Q4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCNYL2Q5T2Q4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCNYL2Q5T2Q4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCNYL2Q5T2Q4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCNYL2Q5T2Q4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCNYL2Q5T2Q4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCNYL2Q5T2Q4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCNYL2Q5T2Q4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCNYL2Q5T2Q4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCNYL2Q5T2Q4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCNYL2Q5T2Q4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCNYL2Q5T2Q4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCNYL2Q5T2Q4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCNYL2Q5T2Q4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCNYL2Q5T2Q4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCNYL2Q5T2Q4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCNYL2Q5T2Q4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCNYL2Q5T2Q4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCNYL2Q5T2Q4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCNYL2Q5T2Q4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCNYL2Q5T2Q4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCNYL2Q5T2Q4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNYL2Q5T2Q4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNYL2Q5T2Q4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCNYL2Q5T2Q4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCNYL2Q5T2Q4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCNYL2Q5T2Q4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNYL2Q5T2Q4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCNYL2Q5T2Q4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCNYL2Q5T2Q4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCNYL2Q5T2Q4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCNYL2Q5T2Q4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNYL2Q5T2Q4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCNYL2Q5T2Q4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCNYL2Q5T2Q4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCNYL2Q5T2Q4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCNYL2Q5T2Q4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCNYL2Q5T2Q4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCNYL2Q5T2Q4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCNYL2Q5T2Q4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCNYL2Q5T2Q4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCNYL2Q5T2Q4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCNYL2Q5T2Q4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCNYL2Q5T2Q4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCNYL2Q5T2Q4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCNYL2Q5T2Q4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCNYL2Q5T2Q4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCNYL2Q5T2Q4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCNYL2Q5T2Q4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCNYL2Q5T2Q4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCNYL2Q5T2Q4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCNYL2Q5T2Q4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCNYL2Q5T2Q4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNYL2Q5T2Q4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNYL2Q5T2Q4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNYL2Q5T2Q4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCNYL2Q5T2Q4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNYL2Q5T2Q4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNYL2Q5T2Q4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCNYL2Q5T2Q4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCNYL2Q5T2Q4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNYL2Q5T2Q4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCNYL2Q5T2Q4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCNYL2Q5T2Q4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCNYL2Q5T2Q4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNYL2Q5T2Q4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNYL2Q5T2Q4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNYL2Q5T2Q4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNYL2Q5T2Q4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCNYL2Q5T2Q4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCNYL2Q5T2Q4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNYL2Q5T2Q4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNYL2Q5T2Q4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNYL2Q5T2Q4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNYL2Q5T2Q4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNYL2Q5T2Q4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNYL2Q5T2Q4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNYL2Q5T2Q4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNYL2Q5T2Q4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228 ms