Protein–RNA interactions for Protein: Q5MAI5

CDKL4, Cyclin-dependent kinase-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL4Q5MAI5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDKL4Q5MAI5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDKL4Q5MAI5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDKL4Q5MAI5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDKL4Q5MAI5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDKL4Q5MAI5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDKL4Q5MAI5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CDKL4Q5MAI5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDKL4Q5MAI5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDKL4Q5MAI5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDKL4Q5MAI5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDKL4Q5MAI5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDKL4Q5MAI5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDKL4Q5MAI5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDKL4Q5MAI5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDKL4Q5MAI5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDKL4Q5MAI5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CDKL4Q5MAI5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDKL4Q5MAI5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDKL4Q5MAI5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDKL4Q5MAI5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDKL4Q5MAI5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDKL4Q5MAI5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDKL4Q5MAI5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDKL4Q5MAI5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDKL4Q5MAI5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDKL4Q5MAI5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDKL4Q5MAI5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDKL4Q5MAI5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKL4Q5MAI5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKL4Q5MAI5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDKL4Q5MAI5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDKL4Q5MAI5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDKL4Q5MAI5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDKL4Q5MAI5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDKL4Q5MAI5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDKL4Q5MAI5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CDKL4Q5MAI5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDKL4Q5MAI5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDKL4Q5MAI5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDKL4Q5MAI5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDKL4Q5MAI5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDKL4Q5MAI5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDKL4Q5MAI5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDKL4Q5MAI5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDKL4Q5MAI5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDKL4Q5MAI5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDKL4Q5MAI5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CDKL4Q5MAI5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDKL4Q5MAI5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDKL4Q5MAI5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDKL4Q5MAI5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDKL4Q5MAI5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDKL4Q5MAI5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDKL4Q5MAI5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDKL4Q5MAI5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDKL4Q5MAI5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDKL4Q5MAI5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDKL4Q5MAI5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDKL4Q5MAI5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDKL4Q5MAI5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDKL4Q5MAI5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDKL4Q5MAI5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDKL4Q5MAI5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKL4Q5MAI5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKL4Q5MAI5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKL4Q5MAI5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDKL4Q5MAI5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDKL4Q5MAI5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDKL4Q5MAI5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDKL4Q5MAI5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDKL4Q5MAI5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDKL4Q5MAI5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDKL4Q5MAI5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDKL4Q5MAI5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDKL4Q5MAI5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDKL4Q5MAI5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDKL4Q5MAI5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDKL4Q5MAI5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDKL4Q5MAI5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDKL4Q5MAI5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDKL4Q5MAI5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDKL4Q5MAI5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDKL4Q5MAI5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDKL4Q5MAI5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDKL4Q5MAI5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDKL4Q5MAI5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDKL4Q5MAI5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDKL4Q5MAI5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDKL4Q5MAI5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDKL4Q5MAI5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDKL4Q5MAI5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDKL4Q5MAI5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDKL4Q5MAI5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDKL4Q5MAI5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDKL4Q5MAI5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDKL4Q5MAI5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDKL4Q5MAI5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDKL4Q5MAI5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDKL4Q5MAI5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms