Protein–RNA interactions for Protein: Q30154

HLA-DRB5, HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 5 chain, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRB5Q30154 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DRB5Q30154 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-DRB5Q30154 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DRB5Q30154 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-DRB5Q30154 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HLA-DRB5Q30154 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-DRB5Q30154 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DRB5Q30154 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DRB5Q30154 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-DRB5Q30154 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DRB5Q30154 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DRB5Q30154 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DRB5Q30154 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-DRB5Q30154 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-DRB5Q30154 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DRB5Q30154 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DRB5Q30154 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DRB5Q30154 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DRB5Q30154 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DRB5Q30154 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DRB5Q30154 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DRB5Q30154 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DRB5Q30154 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DRB5Q30154 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DRB5Q30154 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DRB5Q30154 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DRB5Q30154 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DRB5Q30154 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DRB5Q30154 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DRB5Q30154 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DRB5Q30154 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HLA-DRB5Q30154 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DRB5Q30154 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DRB5Q30154 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DRB5Q30154 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DRB5Q30154 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DRB5Q30154 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DRB5Q30154 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DRB5Q30154 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRB5Q30154 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRB5Q30154 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRB5Q30154 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DRB5Q30154 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DRB5Q30154 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DRB5Q30154 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DRB5Q30154 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DRB5Q30154 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DRB5Q30154 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DRB5Q30154 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DRB5Q30154 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DRB5Q30154 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DRB5Q30154 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DRB5Q30154 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DRB5Q30154 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DRB5Q30154 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DRB5Q30154 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DRB5Q30154 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DRB5Q30154 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DRB5Q30154 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DRB5Q30154 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DRB5Q30154 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DRB5Q30154 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DRB5Q30154 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DRB5Q30154 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DRB5Q30154 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DRB5Q30154 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DRB5Q30154 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DRB5Q30154 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DRB5Q30154 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-DRB5Q30154 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRB5Q30154 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRB5Q30154 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-DRB5Q30154 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRB5Q30154 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-DRB5Q30154 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DRB5Q30154 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-DRB5Q30154 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-DRB5Q30154 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-DRB5Q30154 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DRB5Q30154 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-DRB5Q30154 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DRB5Q30154 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DRB5Q30154 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DRB5Q30154 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DRB5Q30154 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-DRB5Q30154 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DRB5Q30154 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-DRB5Q30154 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DRB5Q30154 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DRB5Q30154 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DRB5Q30154 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DRB5Q30154 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-DRB5Q30154 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-DRB5Q30154 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DRB5Q30154 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DRB5Q30154 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DRB5Q30154 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DRB5Q30154 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DRB5Q30154 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DRB5Q30154 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms