Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MICBQ29980 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MICBQ29980 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MICBQ29980 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MICBQ29980 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MICBQ29980 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MICBQ29980 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MICBQ29980 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MICBQ29980 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MICBQ29980 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MICBQ29980 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MICBQ29980 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MICBQ29980 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MICBQ29980 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MICBQ29980 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MICBQ29980 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MICBQ29980 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MICBQ29980 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MICBQ29980 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MICBQ29980 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MICBQ29980 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MICBQ29980 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MICBQ29980 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MICBQ29980 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MICBQ29980 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MICBQ29980 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MICBQ29980 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MICBQ29980 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MICBQ29980 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MICBQ29980 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MICBQ29980 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MICBQ29980 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MICBQ29980 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MICBQ29980 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MICBQ29980 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MICBQ29980 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MICBQ29980 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MICBQ29980 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MICBQ29980 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MICBQ29980 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MICBQ29980 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MICBQ29980 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MICBQ29980 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MICBQ29980 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MICBQ29980 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MICBQ29980 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MICBQ29980 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MICBQ29980 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MICBQ29980 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MICBQ29980 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MICBQ29980 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MICBQ29980 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MICBQ29980 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MICBQ29980 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MICBQ29980 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MICBQ29980 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MICBQ29980 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MICBQ29980 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MICBQ29980 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MICBQ29980 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MICBQ29980 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MICBQ29980 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MICBQ29980 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MICBQ29980 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
MICBQ29980 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MICBQ29980 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MICBQ29980 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MICBQ29980 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MICBQ29980 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MICBQ29980 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MICBQ29980 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MICBQ29980 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MICBQ29980 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MICBQ29980 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MICBQ29980 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MICBQ29980 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MICBQ29980 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MICBQ29980 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MICBQ29980 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MICBQ29980 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MICBQ29980 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MICBQ29980 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MICBQ29980 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MICBQ29980 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MICBQ29980 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MICBQ29980 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MICBQ29980 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MICBQ29980 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MICBQ29980 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MICBQ29980 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MICBQ29980 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MICBQ29980 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MICBQ29980 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MICBQ29980 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MICBQ29980 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MICBQ29980 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MICBQ29980 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MICBQ29980 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MICBQ29980 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MICBQ29980 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms