Protein–RNA interactions for Protein: Q14739

LBR, Lamin-B receptor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBRQ14739 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LBRQ14739 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LBRQ14739 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LBRQ14739 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LBRQ14739 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LBRQ14739 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LBRQ14739 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LBRQ14739 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LBRQ14739 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LBRQ14739 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LBRQ14739 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LBRQ14739 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LBRQ14739 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LBRQ14739 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LBRQ14739 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LBRQ14739 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LBRQ14739 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LBRQ14739 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LBRQ14739 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LBRQ14739 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LBRQ14739 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LBRQ14739 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LBRQ14739 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LBRQ14739 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LBRQ14739 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LBRQ14739 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LBRQ14739 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LBRQ14739 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LBRQ14739 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LBRQ14739 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LBRQ14739 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LBRQ14739 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LBRQ14739 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LBRQ14739 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LBRQ14739 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LBRQ14739 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LBRQ14739 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LBRQ14739 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LBRQ14739 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LBRQ14739 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LBRQ14739 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LBRQ14739 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LBRQ14739 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LBRQ14739 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LBRQ14739 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LBRQ14739 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LBRQ14739 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LBRQ14739 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LBRQ14739 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LBRQ14739 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LBRQ14739 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LBRQ14739 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LBRQ14739 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LBRQ14739 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LBRQ14739 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LBRQ14739 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LBRQ14739 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LBRQ14739 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LBRQ14739 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LBRQ14739 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LBRQ14739 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LBRQ14739 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LBRQ14739 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LBRQ14739 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LBRQ14739 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LBRQ14739 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LBRQ14739 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LBRQ14739 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LBRQ14739 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LBRQ14739 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LBRQ14739 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LBRQ14739 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LBRQ14739 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LBRQ14739 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LBRQ14739 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LBRQ14739 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LBRQ14739 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LBRQ14739 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LBRQ14739 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LBRQ14739 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LBRQ14739 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LBRQ14739 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LBRQ14739 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LBRQ14739 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LBRQ14739 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LBRQ14739 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LBRQ14739 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LBRQ14739 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LBRQ14739 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LBRQ14739 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LBRQ14739 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LBRQ14739 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LBRQ14739 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LBRQ14739 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LBRQ14739 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LBRQ14739 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LBRQ14739 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LBRQ14739 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LBRQ14739 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LBRQ14739 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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