Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SEMA3AQ14563 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEMA3AQ14563 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEMA3AQ14563 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEMA3AQ14563 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA3AQ14563 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEMA3AQ14563 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEMA3AQ14563 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEMA3AQ14563 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA3AQ14563 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA3AQ14563 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA3AQ14563 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA3AQ14563 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA3AQ14563 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA3AQ14563 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA3AQ14563 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA3AQ14563 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA3AQ14563 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA3AQ14563 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3AQ14563 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA3AQ14563 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA3AQ14563 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA3AQ14563 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA3AQ14563 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA3AQ14563 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA3AQ14563 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA3AQ14563 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA3AQ14563 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEMA3AQ14563 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SEMA3AQ14563 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SEMA3AQ14563 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEMA3AQ14563 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SEMA3AQ14563 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEMA3AQ14563 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEMA3AQ14563 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA3AQ14563 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA3AQ14563 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA3AQ14563 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA3AQ14563 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA3AQ14563 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA3AQ14563 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA3AQ14563 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA3AQ14563 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA3AQ14563 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA3AQ14563 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA3AQ14563 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMA3AQ14563 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMA3AQ14563 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMA3AQ14563 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMA3AQ14563 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SEMA3AQ14563 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA3AQ14563 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEMA3AQ14563 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEMA3AQ14563 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEMA3AQ14563 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEMA3AQ14563 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEMA3AQ14563 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA3AQ14563 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA3AQ14563 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA3AQ14563 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA3AQ14563 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEMA3AQ14563 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEMA3AQ14563 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA3AQ14563 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA3AQ14563 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEMA3AQ14563 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEMA3AQ14563 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEMA3AQ14563 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA3AQ14563 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA3AQ14563 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA3AQ14563 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA3AQ14563 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEMA3AQ14563 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEMA3AQ14563 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEMA3AQ14563 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA3AQ14563 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA3AQ14563 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEMA3AQ14563 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEMA3AQ14563 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEMA3AQ14563 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEMA3AQ14563 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA3AQ14563 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEMA3AQ14563 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEMA3AQ14563 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMA3AQ14563 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMA3AQ14563 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMA3AQ14563 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEMA3AQ14563 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEMA3AQ14563 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SEMA3AQ14563 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEMA3AQ14563 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3AQ14563 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3AQ14563 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3AQ14563 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEMA3AQ14563 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEMA3AQ14563 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEMA3AQ14563 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SEMA3AQ14563 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA3AQ14563 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA3AQ14563 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
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