Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGA9Q13797 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGA9Q13797 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGA9Q13797 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGA9Q13797 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA9Q13797 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA9Q13797 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA9Q13797 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA9Q13797 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA9Q13797 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA9Q13797 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGA9Q13797 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGA9Q13797 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGA9Q13797 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGA9Q13797 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGA9Q13797 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGA9Q13797 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA9Q13797 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA9Q13797 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA9Q13797 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGA9Q13797 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGA9Q13797 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGA9Q13797 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGA9Q13797 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGA9Q13797 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
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ITGA9Q13797 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGA9Q13797 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGA9Q13797 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGA9Q13797 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGA9Q13797 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA9Q13797 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA9Q13797 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGA9Q13797 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGA9Q13797 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGA9Q13797 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGA9Q13797 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGA9Q13797 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGA9Q13797 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
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ITGA9Q13797 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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ITGA9Q13797 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
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ITGA9Q13797 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGA9Q13797 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
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ITGA9Q13797 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
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ITGA9Q13797 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
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ITGA9Q13797 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
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ITGA9Q13797 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
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ITGA9Q13797 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA9Q13797 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA9Q13797 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGA9Q13797 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA9Q13797 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGA9Q13797 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ITGA9Q13797 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGA9Q13797 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGA9Q13797 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGA9Q13797 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGA9Q13797 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGA9Q13797 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGA9Q13797 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA9Q13797 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGA9Q13797 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGA9Q13797 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGA9Q13797 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGA9Q13797 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA9Q13797 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA9Q13797 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
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