Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNASE1L3Q13609 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNASE1L3Q13609 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNASE1L3Q13609 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DNASE1L3Q13609 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DNASE1L3Q13609 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DNASE1L3Q13609 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNASE1L3Q13609 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNASE1L3Q13609 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNASE1L3Q13609 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNASE1L3Q13609 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNASE1L3Q13609 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNASE1L3Q13609 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNASE1L3Q13609 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNASE1L3Q13609 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNASE1L3Q13609 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNASE1L3Q13609 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNASE1L3Q13609 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNASE1L3Q13609 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNASE1L3Q13609 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNASE1L3Q13609 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DNASE1L3Q13609 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNASE1L3Q13609 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNASE1L3Q13609 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNASE1L3Q13609 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNASE1L3Q13609 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNASE1L3Q13609 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNASE1L3Q13609 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNASE1L3Q13609 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNASE1L3Q13609 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNASE1L3Q13609 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNASE1L3Q13609 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNASE1L3Q13609 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNASE1L3Q13609 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNASE1L3Q13609 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNASE1L3Q13609 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DNASE1L3Q13609 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DNASE1L3Q13609 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNASE1L3Q13609 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNASE1L3Q13609 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNASE1L3Q13609 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNASE1L3Q13609 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNASE1L3Q13609 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DNASE1L3Q13609 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DNASE1L3Q13609 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DNASE1L3Q13609 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DNASE1L3Q13609 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DNASE1L3Q13609 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DNASE1L3Q13609 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
DNASE1L3Q13609 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNASE1L3Q13609 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNASE1L3Q13609 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DNASE1L3Q13609 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DNASE1L3Q13609 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNASE1L3Q13609 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNASE1L3Q13609 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNASE1L3Q13609 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNASE1L3Q13609 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNASE1L3Q13609 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNASE1L3Q13609 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNASE1L3Q13609 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNASE1L3Q13609 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNASE1L3Q13609 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNASE1L3Q13609 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNASE1L3Q13609 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNASE1L3Q13609 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNASE1L3Q13609 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNASE1L3Q13609 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNASE1L3Q13609 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DNASE1L3Q13609 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNASE1L3Q13609 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DNASE1L3Q13609 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNASE1L3Q13609 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNASE1L3Q13609 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNASE1L3Q13609 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNASE1L3Q13609 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNASE1L3Q13609 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNASE1L3Q13609 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNASE1L3Q13609 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNASE1L3Q13609 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DNASE1L3Q13609 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNASE1L3Q13609 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNASE1L3Q13609 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNASE1L3Q13609 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNASE1L3Q13609 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNASE1L3Q13609 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNASE1L3Q13609 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNASE1L3Q13609 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNASE1L3Q13609 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNASE1L3Q13609 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNASE1L3Q13609 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNASE1L3Q13609 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNASE1L3Q13609 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNASE1L3Q13609 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNASE1L3Q13609 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNASE1L3Q13609 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNASE1L3Q13609 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNASE1L3Q13609 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DNASE1L3Q13609 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DNASE1L3Q13609 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
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