Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
DNASE1L3Q13609 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
DNASE1L3Q13609 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DNASE1L3Q13609 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
DNASE1L3Q13609 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
DNASE1L3Q13609 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
DNASE1L3Q13609 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
DNASE1L3Q13609 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
DNASE1L3Q13609 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
DNASE1L3Q13609 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
DNASE1L3Q13609 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DNASE1L3Q13609 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
DNASE1L3Q13609 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
DNASE1L3Q13609 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
DNASE1L3Q13609 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DNASE1L3Q13609 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
DNASE1L3Q13609 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
DNASE1L3Q13609 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DNASE1L3Q13609 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DNASE1L3Q13609 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DNASE1L3Q13609 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DNASE1L3Q13609 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DNASE1L3Q13609 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DNASE1L3Q13609 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DNASE1L3Q13609 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DNASE1L3Q13609 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DNASE1L3Q13609 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DNASE1L3Q13609 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DNASE1L3Q13609 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DNASE1L3Q13609 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DNASE1L3Q13609 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DNASE1L3Q13609 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DNASE1L3Q13609 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DNASE1L3Q13609 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DNASE1L3Q13609 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DNASE1L3Q13609 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DNASE1L3Q13609 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNASE1L3Q13609 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DNASE1L3Q13609 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNASE1L3Q13609 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DNASE1L3Q13609 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
DNASE1L3Q13609 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
DNASE1L3Q13609 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
DNASE1L3Q13609 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DNASE1L3Q13609 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNASE1L3Q13609 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNASE1L3Q13609 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNASE1L3Q13609 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNASE1L3Q13609 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DNASE1L3Q13609 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNASE1L3Q13609 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DNASE1L3Q13609 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DNASE1L3Q13609 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DNASE1L3Q13609 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNASE1L3Q13609 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNASE1L3Q13609 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNASE1L3Q13609 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNASE1L3Q13609 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNASE1L3Q13609 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNASE1L3Q13609 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNASE1L3Q13609 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNASE1L3Q13609 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNASE1L3Q13609 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DNASE1L3Q13609 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNASE1L3Q13609 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
DNASE1L3Q13609 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNASE1L3Q13609 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNASE1L3Q13609 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNASE1L3Q13609 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNASE1L3Q13609 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNASE1L3Q13609 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNASE1L3Q13609 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNASE1L3Q13609 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNASE1L3Q13609 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNASE1L3Q13609 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNASE1L3Q13609 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNASE1L3Q13609 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNASE1L3Q13609 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNASE1L3Q13609 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DNASE1L3Q13609 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DNASE1L3Q13609 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DNASE1L3Q13609 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
DNASE1L3Q13609 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
DNASE1L3Q13609 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNASE1L3Q13609 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNASE1L3Q13609 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNASE1L3Q13609 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DNASE1L3Q13609 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DNASE1L3Q13609 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DNASE1L3Q13609 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DNASE1L3Q13609 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DNASE1L3Q13609 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNASE1L3Q13609 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNASE1L3Q13609 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DNASE1L3Q13609 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DNASE1L3Q13609 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNASE1L3Q13609 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNASE1L3Q13609 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNASE1L3Q13609 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNASE1L3Q13609 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
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