Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK18Q07002 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK18Q07002 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK18Q07002 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK18Q07002 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK18Q07002 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK18Q07002 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK18Q07002 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK18Q07002 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK18Q07002 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK18Q07002 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK18Q07002 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK18Q07002 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK18Q07002 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK18Q07002 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK18Q07002 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDK18Q07002 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK18Q07002 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK18Q07002 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK18Q07002 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK18Q07002 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK18Q07002 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK18Q07002 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK18Q07002 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK18Q07002 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK18Q07002 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK18Q07002 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK18Q07002 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK18Q07002 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK18Q07002 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK18Q07002 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK18Q07002 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK18Q07002 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK18Q07002 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK18Q07002 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK18Q07002 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK18Q07002 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK18Q07002 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK18Q07002 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK18Q07002 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK18Q07002 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK18Q07002 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK18Q07002 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK18Q07002 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK18Q07002 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK18Q07002 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK18Q07002 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK18Q07002 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK18Q07002 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CDK18Q07002 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK18Q07002 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK18Q07002 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK18Q07002 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK18Q07002 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK18Q07002 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK18Q07002 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK18Q07002 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK18Q07002 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK18Q07002 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK18Q07002 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK18Q07002 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK18Q07002 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK18Q07002 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK18Q07002 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK18Q07002 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK18Q07002 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK18Q07002 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK18Q07002 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK18Q07002 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK18Q07002 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK18Q07002 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK18Q07002 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK18Q07002 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK18Q07002 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK18Q07002 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK18Q07002 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK18Q07002 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK18Q07002 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK18Q07002 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK18Q07002 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK18Q07002 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK18Q07002 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK18Q07002 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK18Q07002 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK18Q07002 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK18Q07002 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK18Q07002 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK18Q07002 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK18Q07002 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK18Q07002 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK18Q07002 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK18Q07002 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK18Q07002 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK18Q07002 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK18Q07002 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK18Q07002 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK18Q07002 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK18Q07002 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK18Q07002 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK18Q07002 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms