Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEP78395 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRAMEP78395 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PRAMEP78395 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEP78395 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRAMEP78395 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEP78395 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEP78395 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRAMEP78395 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRAMEP78395 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRAMEP78395 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRAMEP78395 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEP78395 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEP78395 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEP78395 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEP78395 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEP78395 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRAMEP78395 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEP78395 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEP78395 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEP78395 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEP78395 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEP78395 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRAMEP78395 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAMEP78395 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAMEP78395 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAMEP78395 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAMEP78395 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAMEP78395 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAMEP78395 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAMEP78395 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEP78395 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEP78395 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEP78395 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEP78395 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAMEP78395 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAMEP78395 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAMEP78395 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRAMEP78395 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEP78395 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEP78395 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEP78395 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEP78395 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEP78395 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEP78395 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEP78395 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEP78395 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEP78395 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEP78395 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEP78395 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRAMEP78395 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PRAMEP78395 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEP78395 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEP78395 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEP78395 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEP78395 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEP78395 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEP78395 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEP78395 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEP78395 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEP78395 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEP78395 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEP78395 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEP78395 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEP78395 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEP78395 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEP78395 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEP78395 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAMEP78395 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAMEP78395 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAMEP78395 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEP78395 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEP78395 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEP78395 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEP78395 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEP78395 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEP78395 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEP78395 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEP78395 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEP78395 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAMEP78395 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEP78395 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEP78395 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEP78395 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEP78395 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEP78395 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEP78395 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEP78395 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEP78395 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEP78395 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEP78395 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEP78395 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEP78395 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEP78395 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEP78395 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEP78395 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEP78395 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEP78395 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEP78395 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRAMEP78395 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms