Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CHMP4BP1P59074 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHMP4BP1P59074 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHMP4BP1P59074 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHMP4BP1P59074 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHMP4BP1P59074 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CHMP4BP1P59074 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CHMP4BP1P59074 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CHMP4BP1P59074 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CHMP4BP1P59074 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CHMP4BP1P59074 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CHMP4BP1P59074 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHMP4BP1P59074 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CHMP4BP1P59074 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CHMP4BP1P59074 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CHMP4BP1P59074 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHMP4BP1P59074 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHMP4BP1P59074 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHMP4BP1P59074 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHMP4BP1P59074 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHMP4BP1P59074 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
CHMP4BP1P59074 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CHMP4BP1P59074 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CHMP4BP1P59074 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHMP4BP1P59074 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHMP4BP1P59074 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHMP4BP1P59074 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHMP4BP1P59074 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CHMP4BP1P59074 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHMP4BP1P59074 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHMP4BP1P59074 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHMP4BP1P59074 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHMP4BP1P59074 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CHMP4BP1P59074 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CHMP4BP1P59074 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHMP4BP1P59074 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHMP4BP1P59074 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHMP4BP1P59074 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHMP4BP1P59074 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHMP4BP1P59074 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
CHMP4BP1P59074 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CHMP4BP1P59074 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CHMP4BP1P59074 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CHMP4BP1P59074 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHMP4BP1P59074 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CHMP4BP1P59074 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHMP4BP1P59074 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHMP4BP1P59074 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHMP4BP1P59074 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CHMP4BP1P59074 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CHMP4BP1P59074 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CHMP4BP1P59074 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHMP4BP1P59074 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHMP4BP1P59074 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHMP4BP1P59074 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHMP4BP1P59074 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
CHMP4BP1P59074 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CHMP4BP1P59074 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CHMP4BP1P59074 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CHMP4BP1P59074 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CHMP4BP1P59074 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CHMP4BP1P59074 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHMP4BP1P59074 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHMP4BP1P59074 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHMP4BP1P59074 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHMP4BP1P59074 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHMP4BP1P59074 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHMP4BP1P59074 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHMP4BP1P59074 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHMP4BP1P59074 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHMP4BP1P59074 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHMP4BP1P59074 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHMP4BP1P59074 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHMP4BP1P59074 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHMP4BP1P59074 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CHMP4BP1P59074 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHMP4BP1P59074 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHMP4BP1P59074 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHMP4BP1P59074 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHMP4BP1P59074 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHMP4BP1P59074 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHMP4BP1P59074 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHMP4BP1P59074 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CHMP4BP1P59074 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHMP4BP1P59074 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHMP4BP1P59074 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHMP4BP1P59074 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHMP4BP1P59074 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHMP4BP1P59074 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHMP4BP1P59074 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHMP4BP1P59074 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHMP4BP1P59074 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHMP4BP1P59074 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHMP4BP1P59074 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHMP4BP1P59074 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHMP4BP1P59074 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHMP4BP1P59074 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHMP4BP1P59074 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHMP4BP1P59074 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHMP4BP1P59074 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms