Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTBP2P56545 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTBP2P56545 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTBP2P56545 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTBP2P56545 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTBP2P56545 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTBP2P56545 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTBP2P56545 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTBP2P56545 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CTBP2P56545 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTBP2P56545 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTBP2P56545 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTBP2P56545 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTBP2P56545 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTBP2P56545 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTBP2P56545 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTBP2P56545 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTBP2P56545 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTBP2P56545 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTBP2P56545 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTBP2P56545 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTBP2P56545 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTBP2P56545 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTBP2P56545 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTBP2P56545 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTBP2P56545 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTBP2P56545 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTBP2P56545 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTBP2P56545 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTBP2P56545 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTBP2P56545 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTBP2P56545 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTBP2P56545 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTBP2P56545 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTBP2P56545 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTBP2P56545 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTBP2P56545 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CTBP2P56545 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTBP2P56545 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTBP2P56545 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTBP2P56545 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTBP2P56545 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTBP2P56545 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTBP2P56545 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTBP2P56545 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTBP2P56545 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTBP2P56545 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTBP2P56545 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTBP2P56545 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTBP2P56545 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTBP2P56545 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTBP2P56545 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTBP2P56545 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTBP2P56545 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTBP2P56545 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTBP2P56545 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTBP2P56545 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTBP2P56545 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTBP2P56545 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTBP2P56545 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTBP2P56545 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTBP2P56545 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTBP2P56545 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTBP2P56545 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTBP2P56545 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTBP2P56545 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTBP2P56545 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTBP2P56545 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTBP2P56545 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTBP2P56545 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTBP2P56545 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTBP2P56545 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTBP2P56545 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTBP2P56545 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTBP2P56545 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTBP2P56545 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTBP2P56545 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTBP2P56545 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CTBP2P56545 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTBP2P56545 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTBP2P56545 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTBP2P56545 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTBP2P56545 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTBP2P56545 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTBP2P56545 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTBP2P56545 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTBP2P56545 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTBP2P56545 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTBP2P56545 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTBP2P56545 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTBP2P56545 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTBP2P56545 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTBP2P56545 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTBP2P56545 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTBP2P56545 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTBP2P56545 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTBP2P56545 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTBP2P56545 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTBP2P56545 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTBP2P56545 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms