Protein–RNA interactions for Protein: P53985

SLC16A1, Monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A1P53985 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC16A1P53985 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC16A1P53985 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC16A1P53985 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC16A1P53985 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC16A1P53985 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC16A1P53985 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC16A1P53985 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC16A1P53985 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC16A1P53985 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC16A1P53985 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC16A1P53985 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC16A1P53985 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC16A1P53985 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC16A1P53985 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC16A1P53985 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC16A1P53985 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC16A1P53985 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC16A1P53985 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC16A1P53985 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC16A1P53985 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC16A1P53985 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC16A1P53985 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC16A1P53985 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC16A1P53985 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC16A1P53985 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC16A1P53985 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC16A1P53985 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC16A1P53985 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC16A1P53985 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC16A1P53985 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC16A1P53985 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC16A1P53985 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC16A1P53985 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC16A1P53985 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC16A1P53985 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC16A1P53985 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC16A1P53985 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC16A1P53985 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC16A1P53985 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC16A1P53985 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC16A1P53985 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC16A1P53985 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC16A1P53985 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC16A1P53985 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC16A1P53985 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC16A1P53985 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC16A1P53985 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC16A1P53985 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC16A1P53985 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC16A1P53985 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC16A1P53985 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC16A1P53985 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC16A1P53985 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC16A1P53985 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC16A1P53985 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC16A1P53985 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC16A1P53985 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC16A1P53985 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC16A1P53985 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC16A1P53985 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC16A1P53985 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC16A1P53985 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC16A1P53985 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC16A1P53985 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC16A1P53985 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC16A1P53985 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC16A1P53985 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC16A1P53985 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC16A1P53985 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC16A1P53985 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC16A1P53985 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC16A1P53985 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC16A1P53985 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC16A1P53985 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC16A1P53985 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC16A1P53985 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC16A1P53985 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC16A1P53985 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC16A1P53985 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC16A1P53985 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC16A1P53985 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC16A1P53985 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC16A1P53985 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC16A1P53985 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC16A1P53985 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC16A1P53985 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC16A1P53985 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC16A1P53985 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC16A1P53985 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC16A1P53985 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC16A1P53985 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC16A1P53985 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC16A1P53985 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC16A1P53985 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC16A1P53985 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC16A1P53985 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC16A1P53985 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC16A1P53985 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC16A1P53985 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms