Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KPNA2P52292 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KPNA2P52292 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KPNA2P52292 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KPNA2P52292 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KPNA2P52292 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KPNA2P52292 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KPNA2P52292 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KPNA2P52292 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KPNA2P52292 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KPNA2P52292 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KPNA2P52292 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KPNA2P52292 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KPNA2P52292 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KPNA2P52292 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KPNA2P52292 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KPNA2P52292 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KPNA2P52292 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KPNA2P52292 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KPNA2P52292 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KPNA2P52292 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KPNA2P52292 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KPNA2P52292 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KPNA2P52292 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KPNA2P52292 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KPNA2P52292 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KPNA2P52292 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KPNA2P52292 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KPNA2P52292 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KPNA2P52292 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KPNA2P52292 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KPNA2P52292 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KPNA2P52292 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
KPNA2P52292 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KPNA2P52292 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KPNA2P52292 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KPNA2P52292 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KPNA2P52292 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KPNA2P52292 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KPNA2P52292 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KPNA2P52292 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KPNA2P52292 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KPNA2P52292 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KPNA2P52292 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KPNA2P52292 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KPNA2P52292 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KPNA2P52292 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KPNA2P52292 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KPNA2P52292 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KPNA2P52292 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KPNA2P52292 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KPNA2P52292 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KPNA2P52292 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KPNA2P52292 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KPNA2P52292 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KPNA2P52292 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KPNA2P52292 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KPNA2P52292 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KPNA2P52292 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KPNA2P52292 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KPNA2P52292 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KPNA2P52292 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KPNA2P52292 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KPNA2P52292 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KPNA2P52292 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KPNA2P52292 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KPNA2P52292 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KPNA2P52292 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KPNA2P52292 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KPNA2P52292 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KPNA2P52292 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KPNA2P52292 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KPNA2P52292 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KPNA2P52292 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KPNA2P52292 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KPNA2P52292 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KPNA2P52292 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KPNA2P52292 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KPNA2P52292 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KPNA2P52292 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KPNA2P52292 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KPNA2P52292 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KPNA2P52292 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KPNA2P52292 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KPNA2P52292 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KPNA2P52292 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KPNA2P52292 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KPNA2P52292 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KPNA2P52292 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KPNA2P52292 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KPNA2P52292 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KPNA2P52292 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KPNA2P52292 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KPNA2P52292 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KPNA2P52292 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KPNA2P52292 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KPNA2P52292 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KPNA2P52292 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KPNA2P52292 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KPNA2P52292 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms