Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCR4P51679 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCR4P51679 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCR4P51679 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCR4P51679 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCR4P51679 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCR4P51679 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCR4P51679 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCR4P51679 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCR4P51679 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCR4P51679 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCR4P51679 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCR4P51679 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCR4P51679 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCR4P51679 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCR4P51679 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCR4P51679 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCR4P51679 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCR4P51679 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCR4P51679 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCR4P51679 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCR4P51679 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCR4P51679 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCR4P51679 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCR4P51679 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCR4P51679 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCR4P51679 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCR4P51679 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCR4P51679 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCR4P51679 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCR4P51679 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCR4P51679 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCR4P51679 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCR4P51679 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR4P51679 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCR4P51679 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCR4P51679 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCR4P51679 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCR4P51679 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCR4P51679 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCR4P51679 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCR4P51679 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCR4P51679 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCR4P51679 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCR4P51679 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCR4P51679 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCR4P51679 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCR4P51679 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCR4P51679 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCR4P51679 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCR4P51679 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCR4P51679 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCR4P51679 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCR4P51679 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCR4P51679 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCR4P51679 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCR4P51679 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCR4P51679 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCR4P51679 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCR4P51679 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCR4P51679 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCR4P51679 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCR4P51679 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCR4P51679 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCR4P51679 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCR4P51679 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCR4P51679 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCR4P51679 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCR4P51679 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCR4P51679 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCR4P51679 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCR4P51679 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCR4P51679 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCR4P51679 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCR4P51679 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCR4P51679 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCR4P51679 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCR4P51679 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCR4P51679 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCR4P51679 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCR4P51679 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCR4P51679 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCR4P51679 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCR4P51679 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCR4P51679 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCR4P51679 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCR4P51679 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCR4P51679 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCR4P51679 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCR4P51679 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCR4P51679 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCR4P51679 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCR4P51679 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCR4P51679 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCR4P51679 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCR4P51679 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCR4P51679 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCR4P51679 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCR4P51679 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCR4P51679 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms