Protein–RNA interactions for Protein: P48060

GLIPR1, Glioma pathogenesis-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIPR1P48060 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLIPR1P48060 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GLIPR1P48060 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLIPR1P48060 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLIPR1P48060 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLIPR1P48060 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLIPR1P48060 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLIPR1P48060 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLIPR1P48060 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLIPR1P48060 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLIPR1P48060 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLIPR1P48060 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLIPR1P48060 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLIPR1P48060 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLIPR1P48060 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLIPR1P48060 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLIPR1P48060 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLIPR1P48060 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLIPR1P48060 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GLIPR1P48060 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLIPR1P48060 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLIPR1P48060 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLIPR1P48060 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLIPR1P48060 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLIPR1P48060 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLIPR1P48060 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLIPR1P48060 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLIPR1P48060 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLIPR1P48060 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLIPR1P48060 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLIPR1P48060 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLIPR1P48060 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLIPR1P48060 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLIPR1P48060 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLIPR1P48060 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLIPR1P48060 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLIPR1P48060 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLIPR1P48060 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLIPR1P48060 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLIPR1P48060 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLIPR1P48060 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLIPR1P48060 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLIPR1P48060 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLIPR1P48060 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLIPR1P48060 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLIPR1P48060 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLIPR1P48060 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLIPR1P48060 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLIPR1P48060 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GLIPR1P48060 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLIPR1P48060 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLIPR1P48060 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLIPR1P48060 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLIPR1P48060 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLIPR1P48060 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLIPR1P48060 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLIPR1P48060 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLIPR1P48060 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLIPR1P48060 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLIPR1P48060 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLIPR1P48060 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLIPR1P48060 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLIPR1P48060 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLIPR1P48060 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLIPR1P48060 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLIPR1P48060 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLIPR1P48060 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLIPR1P48060 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLIPR1P48060 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLIPR1P48060 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GLIPR1P48060 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLIPR1P48060 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLIPR1P48060 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLIPR1P48060 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLIPR1P48060 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLIPR1P48060 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLIPR1P48060 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLIPR1P48060 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLIPR1P48060 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLIPR1P48060 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLIPR1P48060 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLIPR1P48060 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLIPR1P48060 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLIPR1P48060 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLIPR1P48060 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLIPR1P48060 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLIPR1P48060 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLIPR1P48060 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLIPR1P48060 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLIPR1P48060 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLIPR1P48060 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLIPR1P48060 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLIPR1P48060 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLIPR1P48060 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLIPR1P48060 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLIPR1P48060 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLIPR1P48060 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLIPR1P48060 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLIPR1P48060 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GLIPR1P48060 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms