Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCK1P35558 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PCK1P35558 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCK1P35558 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCK1P35558 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCK1P35558 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCK1P35558 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCK1P35558 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCK1P35558 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCK1P35558 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCK1P35558 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCK1P35558 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCK1P35558 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCK1P35558 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCK1P35558 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCK1P35558 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCK1P35558 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCK1P35558 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCK1P35558 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCK1P35558 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCK1P35558 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCK1P35558 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCK1P35558 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCK1P35558 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCK1P35558 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCK1P35558 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCK1P35558 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCK1P35558 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCK1P35558 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCK1P35558 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCK1P35558 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCK1P35558 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCK1P35558 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCK1P35558 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCK1P35558 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCK1P35558 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCK1P35558 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCK1P35558 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCK1P35558 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCK1P35558 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCK1P35558 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCK1P35558 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCK1P35558 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCK1P35558 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCK1P35558 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCK1P35558 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCK1P35558 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCK1P35558 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCK1P35558 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCK1P35558 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCK1P35558 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCK1P35558 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCK1P35558 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCK1P35558 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
PCK1P35558 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCK1P35558 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCK1P35558 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCK1P35558 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCK1P35558 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCK1P35558 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCK1P35558 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCK1P35558 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCK1P35558 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCK1P35558 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCK1P35558 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PCK1P35558 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCK1P35558 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCK1P35558 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCK1P35558 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCK1P35558 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCK1P35558 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCK1P35558 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCK1P35558 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCK1P35558 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCK1P35558 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCK1P35558 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCK1P35558 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCK1P35558 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCK1P35558 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCK1P35558 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCK1P35558 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCK1P35558 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCK1P35558 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCK1P35558 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCK1P35558 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCK1P35558 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCK1P35558 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCK1P35558 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCK1P35558 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCK1P35558 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCK1P35558 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCK1P35558 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCK1P35558 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCK1P35558 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCK1P35558 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCK1P35558 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCK1P35558 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCK1P35558 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCK1P35558 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCK1P35558 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms