Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC12P31275 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC12P31275 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC12P31275 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC12P31275 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC12P31275 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC12P31275 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC12P31275 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC12P31275 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC12P31275 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC12P31275 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC12P31275 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC12P31275 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC12P31275 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC12P31275 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC12P31275 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC12P31275 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC12P31275 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC12P31275 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC12P31275 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC12P31275 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC12P31275 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC12P31275 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXC12P31275 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC12P31275 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC12P31275 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC12P31275 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC12P31275 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC12P31275 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC12P31275 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC12P31275 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC12P31275 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC12P31275 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC12P31275 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC12P31275 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC12P31275 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC12P31275 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC12P31275 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC12P31275 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXC12P31275 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC12P31275 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC12P31275 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC12P31275 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC12P31275 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC12P31275 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC12P31275 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC12P31275 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC12P31275 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC12P31275 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC12P31275 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC12P31275 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC12P31275 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC12P31275 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXC12P31275 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC12P31275 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC12P31275 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC12P31275 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXC12P31275 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC12P31275 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXC12P31275 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXC12P31275 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXC12P31275 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXC12P31275 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXC12P31275 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC12P31275 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC12P31275 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC12P31275 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC12P31275 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC12P31275 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC12P31275 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC12P31275 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC12P31275 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC12P31275 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC12P31275 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC12P31275 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC12P31275 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC12P31275 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC12P31275 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC12P31275 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC12P31275 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC12P31275 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC12P31275 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC12P31275 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC12P31275 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC12P31275 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC12P31275 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC12P31275 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC12P31275 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC12P31275 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC12P31275 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC12P31275 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC12P31275 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC12P31275 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC12P31275 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC12P31275 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC12P31275 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC12P31275 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC12P31275 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC12P31275 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC12P31275 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms