Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HOXC12P31275 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXC12P31275 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXC12P31275 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXC12P31275 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXC12P31275 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXC12P31275 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXC12P31275 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXC12P31275 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXC12P31275 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOXC12P31275 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXC12P31275 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXC12P31275 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXC12P31275 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXC12P31275 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXC12P31275 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXC12P31275 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXC12P31275 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXC12P31275 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC12P31275 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXC12P31275 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXC12P31275 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXC12P31275 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXC12P31275 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXC12P31275 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXC12P31275 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC12P31275 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXC12P31275 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXC12P31275 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXC12P31275 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXC12P31275 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXC12P31275 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXC12P31275 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXC12P31275 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXC12P31275 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXC12P31275 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXC12P31275 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXC12P31275 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC12P31275 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXC12P31275 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC12P31275 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC12P31275 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXC12P31275 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXC12P31275 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXC12P31275 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXC12P31275 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXC12P31275 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXC12P31275 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC12P31275 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC12P31275 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC12P31275 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXC12P31275 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXC12P31275 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXC12P31275 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC12P31275 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC12P31275 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC12P31275 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXC12P31275 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXC12P31275 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXC12P31275 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXC12P31275 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC12P31275 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXC12P31275 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC12P31275 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC12P31275 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXC12P31275 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC12P31275 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC12P31275 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC12P31275 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC12P31275 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HOXC12P31275 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC12P31275 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC12P31275 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC12P31275 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC12P31275 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC12P31275 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXC12P31275 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC12P31275 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC12P31275 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC12P31275 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXC12P31275 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC12P31275 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC12P31275 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC12P31275 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXC12P31275 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC12P31275 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC12P31275 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC12P31275 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC12P31275 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC12P31275 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC12P31275 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC12P31275 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXC12P31275 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXC12P31275 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC12P31275 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXC12P31275 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC12P31275 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXC12P31275 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXC12P31275 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXC12P31275 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms