Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSR1P21757 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSR1P21757 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSR1P21757 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSR1P21757 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSR1P21757 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSR1P21757 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSR1P21757 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSR1P21757 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSR1P21757 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSR1P21757 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSR1P21757 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSR1P21757 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSR1P21757 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MSR1P21757 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MSR1P21757 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSR1P21757 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSR1P21757 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSR1P21757 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSR1P21757 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSR1P21757 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSR1P21757 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSR1P21757 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSR1P21757 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSR1P21757 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSR1P21757 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSR1P21757 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSR1P21757 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSR1P21757 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSR1P21757 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSR1P21757 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSR1P21757 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSR1P21757 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSR1P21757 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSR1P21757 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSR1P21757 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSR1P21757 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSR1P21757 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSR1P21757 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSR1P21757 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSR1P21757 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSR1P21757 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSR1P21757 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSR1P21757 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSR1P21757 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSR1P21757 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSR1P21757 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MSR1P21757 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSR1P21757 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSR1P21757 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSR1P21757 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSR1P21757 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSR1P21757 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSR1P21757 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSR1P21757 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSR1P21757 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSR1P21757 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSR1P21757 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSR1P21757 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSR1P21757 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSR1P21757 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSR1P21757 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSR1P21757 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSR1P21757 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSR1P21757 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSR1P21757 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSR1P21757 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSR1P21757 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSR1P21757 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSR1P21757 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSR1P21757 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSR1P21757 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSR1P21757 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSR1P21757 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSR1P21757 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSR1P21757 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSR1P21757 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSR1P21757 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSR1P21757 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSR1P21757 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSR1P21757 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSR1P21757 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSR1P21757 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSR1P21757 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSR1P21757 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSR1P21757 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSR1P21757 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSR1P21757 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSR1P21757 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSR1P21757 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSR1P21757 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MSR1P21757 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSR1P21757 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSR1P21757 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSR1P21757 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSR1P21757 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSR1P21757 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSR1P21757 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSR1P21757 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSR1P21757 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms