Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MUC1P15941 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MUC1P15941 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MUC1P15941 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MUC1P15941 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MUC1P15941 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MUC1P15941 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MUC1P15941 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MUC1P15941 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MUC1P15941 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MUC1P15941 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MUC1P15941 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC1P15941 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MUC1P15941 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MUC1P15941 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MUC1P15941 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MUC1P15941 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MUC1P15941 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MUC1P15941 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MUC1P15941 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MUC1P15941 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MUC1P15941 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MUC1P15941 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MUC1P15941 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MUC1P15941 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MUC1P15941 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MUC1P15941 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MUC1P15941 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MUC1P15941 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MUC1P15941 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MUC1P15941 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MUC1P15941 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MUC1P15941 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC1P15941 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC1P15941 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC1P15941 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MUC1P15941 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MUC1P15941 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MUC1P15941 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MUC1P15941 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MUC1P15941 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MUC1P15941 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MUC1P15941 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MUC1P15941 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MUC1P15941 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MUC1P15941 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MUC1P15941 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MUC1P15941 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MUC1P15941 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MUC1P15941 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MUC1P15941 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MUC1P15941 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MUC1P15941 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MUC1P15941 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MUC1P15941 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MUC1P15941 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MUC1P15941 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MUC1P15941 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MUC1P15941 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MUC1P15941 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MUC1P15941 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MUC1P15941 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MUC1P15941 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MUC1P15941 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MUC1P15941 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MUC1P15941 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MUC1P15941 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MUC1P15941 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MUC1P15941 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MUC1P15941 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MUC1P15941 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MUC1P15941 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MUC1P15941 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MUC1P15941 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MUC1P15941 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MUC1P15941 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MUC1P15941 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MUC1P15941 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MUC1P15941 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MUC1P15941 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MUC1P15941 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MUC1P15941 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MUC1P15941 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MUC1P15941 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MUC1P15941 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MUC1P15941 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MUC1P15941 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MUC1P15941 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MUC1P15941 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MUC1P15941 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MUC1P15941 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MUC1P15941 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MUC1P15941 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MUC1P15941 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MUC1P15941 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MUC1P15941 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MUC1P15941 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MUC1P15941 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MUC1P15941 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MUC1P15941 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms