Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGA3P0DJD8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGA3P0DJD8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGA3P0DJD8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGA3P0DJD8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGA3P0DJD8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGA3P0DJD8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGA3P0DJD8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGA3P0DJD8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGA3P0DJD8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGA3P0DJD8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGA3P0DJD8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGA3P0DJD8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGA3P0DJD8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGA3P0DJD8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGA3P0DJD8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGA3P0DJD8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGA3P0DJD8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGA3P0DJD8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGA3P0DJD8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGA3P0DJD8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGA3P0DJD8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGA3P0DJD8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGA3P0DJD8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGA3P0DJD8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGA3P0DJD8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGA3P0DJD8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGA3P0DJD8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGA3P0DJD8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGA3P0DJD8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGA3P0DJD8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGA3P0DJD8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGA3P0DJD8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGA3P0DJD8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGA3P0DJD8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGA3P0DJD8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGA3P0DJD8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGA3P0DJD8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGA3P0DJD8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGA3P0DJD8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGA3P0DJD8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGA3P0DJD8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGA3P0DJD8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGA3P0DJD8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGA3P0DJD8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGA3P0DJD8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGA3P0DJD8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGA3P0DJD8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PGA3P0DJD8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGA3P0DJD8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGA3P0DJD8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGA3P0DJD8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGA3P0DJD8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGA3P0DJD8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGA3P0DJD8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGA3P0DJD8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGA3P0DJD8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGA3P0DJD8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGA3P0DJD8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGA3P0DJD8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGA3P0DJD8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGA3P0DJD8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGA3P0DJD8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGA3P0DJD8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGA3P0DJD8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGA3P0DJD8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGA3P0DJD8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGA3P0DJD8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGA3P0DJD8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGA3P0DJD8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGA3P0DJD8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGA3P0DJD8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGA3P0DJD8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PGA3P0DJD8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGA3P0DJD8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGA3P0DJD8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGA3P0DJD8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGA3P0DJD8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGA3P0DJD8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGA3P0DJD8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGA3P0DJD8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGA3P0DJD8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGA3P0DJD8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGA3P0DJD8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGA3P0DJD8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGA3P0DJD8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGA3P0DJD8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGA3P0DJD8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGA3P0DJD8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGA3P0DJD8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGA3P0DJD8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGA3P0DJD8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGA3P0DJD8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGA3P0DJD8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGA3P0DJD8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGA3P0DJD8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGA3P0DJD8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGA3P0DJD8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGA3P0DJD8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGA3P0DJD8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms