Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
HOXB7P09629 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
HOXB7P09629 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
HOXB7P09629 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
HOXB7P09629 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
HOXB7P09629 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
HOXB7P09629 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
HOXB7P09629 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
HOXB7P09629 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
HOXB7P09629 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
HOXB7P09629 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
HOXB7P09629 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
HOXB7P09629 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
HOXB7P09629 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
HOXB7P09629 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
HOXB7P09629 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
HOXB7P09629 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
HOXB7P09629 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
HOXB7P09629 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
HOXB7P09629 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
HOXB7P09629 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
HOXB7P09629 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
HOXB7P09629 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
HOXB7P09629 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
HOXB7P09629 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
HOXB7P09629 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
HOXB7P09629 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
HOXB7P09629 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
HOXB7P09629 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
HOXB7P09629 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
HOXB7P09629 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
HOXB7P09629 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
HOXB7P09629 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
HOXB7P09629 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
HOXB7P09629 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
HOXB7P09629 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
HOXB7P09629 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
HOXB7P09629 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
HOXB7P09629 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
HOXB7P09629 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
HOXB7P09629 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
HOXB7P09629 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
HOXB7P09629 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
HOXB7P09629 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
HOXB7P09629 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
HOXB7P09629 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
HOXB7P09629 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
HOXB7P09629 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
HOXB7P09629 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
HOXB7P09629 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
HOXB7P09629 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
HOXB7P09629 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
HOXB7P09629 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
HOXB7P09629 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
HOXB7P09629 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
HOXB7P09629 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
HOXB7P09629 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
HOXB7P09629 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
HOXB7P09629 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
HOXB7P09629 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
HOXB7P09629 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
HOXB7P09629 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
HOXB7P09629 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
HOXB7P09629 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
HOXB7P09629 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
HOXB7P09629 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
HOXB7P09629 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HOXB7P09629 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
HOXB7P09629 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
HOXB7P09629 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
HOXB7P09629 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HOXB7P09629 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
HOXB7P09629 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
HOXB7P09629 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
HOXB7P09629 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HOXB7P09629 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
HOXB7P09629 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
HOXB7P09629 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
HOXB7P09629 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
HOXB7P09629 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
HOXB7P09629 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
HOXB7P09629 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
HOXB7P09629 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
HOXB7P09629 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
HOXB7P09629 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
HOXB7P09629 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
HOXB7P09629 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
HOXB7P09629 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HOXB7P09629 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
HOXB7P09629 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HOXB7P09629 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
HOXB7P09629 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
HOXB7P09629 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
HOXB7P09629 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
HOXB7P09629 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
HOXB7P09629 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
HOXB7P09629 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
HOXB7P09629 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HOXB7P09629 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
HOXB7P09629 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms