Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC44.37■■■■■ 4.69
HOXB7P09629 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
HOXB7P09629 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC43.11■■■■■ 4.49
HOXB7P09629 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
HOXB7P09629 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
HOXB7P09629 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
HOXB7P09629 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
HOXB7P09629 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
HOXB7P09629 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
HOXB7P09629 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
HOXB7P09629 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
HOXB7P09629 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
HOXB7P09629 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
HOXB7P09629 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
HOXB7P09629 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
HOXB7P09629 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
HOXB7P09629 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
HOXB7P09629 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.16
HOXB7P09629 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
HOXB7P09629 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
HOXB7P09629 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
HOXB7P09629 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
HOXB7P09629 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
HOXB7P09629 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
HOXB7P09629 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
HOXB7P09629 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
HOXB7P09629 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
HOXB7P09629 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
HOXB7P09629 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
HOXB7P09629 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
HOXB7P09629 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
HOXB7P09629 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
HOXB7P09629 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
HOXB7P09629 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
HOXB7P09629 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
HOXB7P09629 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
HOXB7P09629 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
HOXB7P09629 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
HOXB7P09629 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.87
HOXB7P09629 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
HOXB7P09629 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
HOXB7P09629 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
HOXB7P09629 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
HOXB7P09629 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
HOXB7P09629 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
HOXB7P09629 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
HOXB7P09629 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
HOXB7P09629 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
HOXB7P09629 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
HOXB7P09629 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
HOXB7P09629 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
HOXB7P09629 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
HOXB7P09629 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
HOXB7P09629 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
HOXB7P09629 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
HOXB7P09629 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
HOXB7P09629 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
HOXB7P09629 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
HOXB7P09629 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
HOXB7P09629 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.4■■■■□ 3.74
HOXB7P09629 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
HOXB7P09629 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
HOXB7P09629 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
HOXB7P09629 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
HOXB7P09629 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.16■■■■□ 3.7
HOXB7P09629 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
HOXB7P09629 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
HOXB7P09629 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
HOXB7P09629 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
HOXB7P09629 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
HOXB7P09629 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
HOXB7P09629 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
HOXB7P09629 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
HOXB7P09629 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
HOXB7P09629 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
HOXB7P09629 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
HOXB7P09629 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
HOXB7P09629 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
HOXB7P09629 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
HOXB7P09629 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
HOXB7P09629 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
HOXB7P09629 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
HOXB7P09629 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
HOXB7P09629 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
HOXB7P09629 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
HOXB7P09629 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
HOXB7P09629 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
HOXB7P09629 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
HOXB7P09629 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
HOXB7P09629 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
HOXB7P09629 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
HOXB7P09629 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
HOXB7P09629 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
HOXB7P09629 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
HOXB7P09629 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
HOXB7P09629 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
HOXB7P09629 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
HOXB7P09629 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
HOXB7P09629 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
HOXB7P09629 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms